23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4896 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_4896  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  265  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0487  hypothetical protein  87.6 
 
 
151 aa  232  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9506  hypothetical protein  83.59 
 
 
128 aa  227  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32400  hypothetical protein  39.67 
 
 
128 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3187  hypothetical protein  41.03 
 
 
134 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6603  hypothetical protein  40.17 
 
 
134 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00602869  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0815  hypothetical protein  39.82 
 
 
123 aa  93.6  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5527  hypothetical protein  38.26 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.750041 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2337  hypothetical protein  35.96 
 
 
123 aa  83.6  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2051  hypothetical protein  37.65 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0797061  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4538  hypothetical protein  33.01 
 
 
123 aa  77.4  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5906  hypothetical protein  32.69 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216643  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5100  hypothetical protein  30.4 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152426  normal  0.477551 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1441  hypothetical protein  30.36 
 
 
155 aa  62  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3367  hypothetical protein  28.16 
 
 
117 aa  60.5  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9550  hypothetical protein  30.1 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4975  hypothetical protein  28.16 
 
 
116 aa  57.4  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4547  hypothetical protein  28.43 
 
 
116 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.401273  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1685  hypothetical protein  29.81 
 
 
121 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3052  hypothetical protein  27.12 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5188  hypothetical protein  29.63 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6205  hypothetical protein  37.1 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5295  hypothetical protein  34.33 
 
 
79 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>