20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3367 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009468  Acry_3367  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  244  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4547  hypothetical protein  66.38 
 
 
116 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.401273  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4975  hypothetical protein  67.24 
 
 
116 aa  177  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9550  hypothetical protein  66.09 
 
 
116 aa  172  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1685  hypothetical protein  45.05 
 
 
121 aa  94.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5100  hypothetical protein  42.06 
 
 
129 aa  84  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152426  normal  0.477551 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1441  hypothetical protein  35.19 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4896  hypothetical protein  28.16 
 
 
128 aa  60.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4538  hypothetical protein  29.09 
 
 
123 aa  60.5  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0487  hypothetical protein  29.13 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6603  hypothetical protein  32.32 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00602869  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9506  hypothetical protein  28.85 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2337  hypothetical protein  28.16 
 
 
123 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2051  hypothetical protein  27.71 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0797061  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6205  hypothetical protein  42.37 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3187  hypothetical protein  27.27 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5527  hypothetical protein  31.73 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.750041 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5295  hypothetical protein  30.99 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0815  hypothetical protein  29.13 
 
 
123 aa  44.7  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32400  hypothetical protein  28.16 
 
 
128 aa  43.9  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>