21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2337 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2337  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  249  7e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2051  hypothetical protein  61.45 
 
 
141 aa  116  7.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0797061  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32400  hypothetical protein  44.53 
 
 
128 aa  107  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0815  hypothetical protein  45.08 
 
 
123 aa  102  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3187  hypothetical protein  44.12 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0487  hypothetical protein  36.84 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4896  hypothetical protein  35.96 
 
 
128 aa  83.6  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9506  hypothetical protein  33.88 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6603  hypothetical protein  42.16 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00602869  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4538  hypothetical protein  41 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5527  hypothetical protein  37.61 
 
 
140 aa  70.1  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.750041 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5906  hypothetical protein  35.19 
 
 
121 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216643  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4547  hypothetical protein  28.43 
 
 
116 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.401273  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3367  hypothetical protein  28.16 
 
 
117 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9550  hypothetical protein  26.47 
 
 
116 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4975  hypothetical protein  28.41 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6205  hypothetical protein  29.41 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5100  hypothetical protein  27.88 
 
 
129 aa  48.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152426  normal  0.477551 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1685  hypothetical protein  28.71 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5295  hypothetical protein  35.59 
 
 
79 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1441  hypothetical protein  27.72 
 
 
155 aa  41.2  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>