22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5906 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5906  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  247  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216643  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5527  hypothetical protein  51.92 
 
 		 140 aa  117  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.750041 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6603  hypothetical protein  41.35 
 
 		 134 aa  90.5  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00602869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3187  hypothetical protein  40.38 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32400  hypothetical protein  40.38 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2051  hypothetical protein  40.48 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0797061  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0487  hypothetical protein  34.62 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0815  hypothetical protein  39.42 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4896  hypothetical protein  32.69 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9506  hypothetical protein  32.69 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2337  hypothetical protein  35.19 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3052  hypothetical protein  37.04 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1441  hypothetical protein  41.33 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5295  hypothetical protein  45.83 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5100  hypothetical protein  38.27 
 
 		 129 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152426  normal  0.477551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5188  hypothetical protein  36.19 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6205  hypothetical protein  38.36 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4538  hypothetical protein  31.65 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1685  hypothetical protein  28.83 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4547  hypothetical protein  30.1 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.401273  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4975  hypothetical protein  35.44 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9550  hypothetical protein  28.16 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>