23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9550 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011991  Avi_9550  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  235  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4547  hypothetical protein  86.21 
 
 		 116 aa  213  7e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.401273  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4975  hypothetical protein  86.21 
 
 		 116 aa  212  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3367  hypothetical protein  66.09 
 
 		 117 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1685  hypothetical protein  42.06 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5100  hypothetical protein  41.28 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152426  normal  0.477551 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1441  hypothetical protein  34.62 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6603  hypothetical protein  33.91 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00602869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4896  hypothetical protein  30.1 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4538  hypothetical protein  28.3 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9506  hypothetical protein  30.1 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0487  hypothetical protein  28.16 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2337  hypothetical protein  26.47 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3187  hypothetical protein  31.31 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2051  hypothetical protein  31.4 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0797061  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5527  hypothetical protein  38.37 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.750041 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6205  hypothetical protein  42.37 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5188  hypothetical protein  31.78 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3052  hypothetical protein  55 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32400  hypothetical protein  26.21 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5295  hypothetical protein  29.73 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0815  hypothetical protein  26.17 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5906  hypothetical protein  28.16 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>