23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4547 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008243  Meso_4547  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  234  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.401273  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4975  hypothetical protein  87.93 
 
 
116 aa  218  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9550  hypothetical protein  86.21 
 
 
116 aa  213  7e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3367  hypothetical protein  66.38 
 
 
117 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1685  hypothetical protein  45.05 
 
 
121 aa  99.8  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5100  hypothetical protein  42.99 
 
 
129 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152426  normal  0.477551 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1441  hypothetical protein  41.84 
 
 
155 aa  80.1  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6603  hypothetical protein  36.89 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00602869  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4538  hypothetical protein  29.57 
 
 
123 aa  62.8  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2337  hypothetical protein  28.43 
 
 
123 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3187  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2051  hypothetical protein  31.33 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0797061  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9506  hypothetical protein  31.25 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4896  hypothetical protein  28.43 
 
 
128 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0487  hypothetical protein  29.41 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5527  hypothetical protein  33.04 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.750041 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6205  hypothetical protein  47.46 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32400  hypothetical protein  29.41 
 
 
128 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5295  hypothetical protein  33.78 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0815  hypothetical protein  28.04 
 
 
123 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5906  hypothetical protein  30.1 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216643  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5188  hypothetical protein  34.33 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3052  hypothetical protein  45 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>