20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3052 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3052  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  263  8e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5188  hypothetical protein  68.42 
 
 
161 aa  177  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3187  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5527  hypothetical protein  31.9 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.750041 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6603  hypothetical protein  33.82 
 
 
134 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00602869  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5906  hypothetical protein  37.96 
 
 
121 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216643  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6205  hypothetical protein  36.23 
 
 
127 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2051  hypothetical protein  27.36 
 
 
141 aa  52.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0797061  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4896  hypothetical protein  28.81 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9506  hypothetical protein  28.45 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0487  hypothetical protein  26.27 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5100  hypothetical protein  29.25 
 
 
129 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152426  normal  0.477551 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5295  hypothetical protein  38.98 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0815  hypothetical protein  27.12 
 
 
123 aa  45.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9550  hypothetical protein  55 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32400  hypothetical protein  29.52 
 
 
128 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4538  hypothetical protein  41.46 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4975  hypothetical protein  45 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1441  hypothetical protein  29.17 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4547  hypothetical protein  45 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.401273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>