23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4538 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4538  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  245  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0815  hypothetical protein  42.34 
 
 		 123 aa  90.9  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32400  hypothetical protein  37.5 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2337  hypothetical protein  41 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6603  hypothetical protein  35.4 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00602869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0487  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4896  hypothetical protein  33.01 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2051  hypothetical protein  40.51 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0797061  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3187  hypothetical protein  34.31 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9506  hypothetical protein  32.08 
 
 		 128 aa  72  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5527  hypothetical protein  35.34 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.750041 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1441  hypothetical protein  34.55 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4547  hypothetical protein  29.57 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.401273  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5100  hypothetical protein  32.73 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152426  normal  0.477551 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1685  hypothetical protein  33.64 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4975  hypothetical protein  30.43 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3367  hypothetical protein  29.09 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9550  hypothetical protein  28.3 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5188  hypothetical protein  28.3 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5906  hypothetical protein  31.65 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216643  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6205  hypothetical protein  31.4 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3052  hypothetical protein  41.46 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5295  hypothetical protein  37.5 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>