22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_32400 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_32400  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  263  5.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0815  hypothetical protein  77.24 
 
 
123 aa  201  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2337  hypothetical protein  44.53 
 
 
123 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3187  hypothetical protein  45.3 
 
 
134 aa  105  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0487  hypothetical protein  42.61 
 
 
151 aa  105  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4896  hypothetical protein  39.67 
 
 
128 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9506  hypothetical protein  39.67 
 
 
128 aa  100  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5527  hypothetical protein  46.15 
 
 
140 aa  100  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.750041 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6603  hypothetical protein  41.88 
 
 
134 aa  95.5  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00602869  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2051  hypothetical protein  45.78 
 
 
141 aa  87.8  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0797061  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4538  hypothetical protein  37.5 
 
 
123 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5906  hypothetical protein  40.38 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216643  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1441  hypothetical protein  34.91 
 
 
155 aa  60.5  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5100  hypothetical protein  34.34 
 
 
129 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152426  normal  0.477551 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6205  hypothetical protein  37.5 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1685  hypothetical protein  35.71 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5188  hypothetical protein  28.99 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4547  hypothetical protein  29.41 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.401273  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4975  hypothetical protein  28.3 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9550  hypothetical protein  26.21 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3367  hypothetical protein  28.16 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3052  hypothetical protein  31.82 
 
 
133 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>