22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5527 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007950  Bpro_5527  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  283  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.750041 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3187  hypothetical protein  51.3 
 
 
134 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6603  hypothetical protein  53.77 
 
 
134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00602869  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5906  hypothetical protein  51.92 
 
 
121 aa  117  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216643  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32400  hypothetical protein  46.15 
 
 
128 aa  100  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0815  hypothetical protein  41.88 
 
 
123 aa  92.8  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4896  hypothetical protein  36.72 
 
 
128 aa  86.7  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2051  hypothetical protein  47.67 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0797061  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0487  hypothetical protein  37.7 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9506  hypothetical protein  40 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2337  hypothetical protein  37.61 
 
 
123 aa  70.1  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4538  hypothetical protein  35.29 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6205  hypothetical protein  45.21 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3052  hypothetical protein  32.82 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5188  hypothetical protein  33.96 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5295  hypothetical protein  48.39 
 
 
79 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1685  hypothetical protein  31.9 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4547  hypothetical protein  33.04 
 
 
116 aa  54.7  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.401273  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9550  hypothetical protein  38.37 
 
 
116 aa  50.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4975  hypothetical protein  36.59 
 
 
116 aa  48.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3367  hypothetical protein  31.73 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5100  hypothetical protein  28.85 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152426  normal  0.477551 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>