23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9506 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011991  Avi_9506  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  263  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4896  hypothetical protein  83.59 
 
 		 128 aa  227  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0487  hypothetical protein  82.95 
 
 		 151 aa  218  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32400  hypothetical protein  39.67 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6603  hypothetical protein  41.03 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00602869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3187  hypothetical protein  39.32 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0815  hypothetical protein  40.71 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2337  hypothetical protein  33.88 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5527  hypothetical protein  40 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.750041 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2051  hypothetical protein  38.82 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0797061  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4538  hypothetical protein  32.08 
 
 		 123 aa  72  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5906  hypothetical protein  32.69 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216643  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5100  hypothetical protein  33.01 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152426  normal  0.477551 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1441  hypothetical protein  29.46 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3367  hypothetical protein  28.85 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9550  hypothetical protein  30.1 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4975  hypothetical protein  28.87 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4547  hypothetical protein  31.25 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.401273  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5295  hypothetical protein  41.79 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5188  hypothetical protein  30.56 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1685  hypothetical protein  26.4 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3052  hypothetical protein  25.42 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6205  hypothetical protein  37.1 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>