20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_5188 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_5188  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  326  9e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3052  hypothetical protein  68.42 
 
 		 133 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6603  hypothetical protein  37.14 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00602869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3187  hypothetical protein  41.43 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5527  hypothetical protein  33.96 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.750041 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9506  hypothetical protein  30.56 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4896  hypothetical protein  29.63 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5906  hypothetical protein  36.19 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216643  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2051  hypothetical protein  31.08 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0797061  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32400  hypothetical protein  28.99 
 
 		 128 aa  48.1  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9550  hypothetical protein  31.78 
 
 		 116 aa  47.8  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155758  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0815  hypothetical protein  27.93 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5100  hypothetical protein  28.71 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152426  normal  0.477551 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4538  hypothetical protein  28.3 
 
 		 123 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0487  hypothetical protein  26.85 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6205  hypothetical protein  40.98 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1441  hypothetical protein  31.25 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4975  hypothetical protein  33.77 
 
 		 116 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4547  hypothetical protein  34.33 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.401273  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1685  hypothetical protein  29.29 
 
 		 121 aa  41.6  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>