More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0667 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0667  30S ribosomal protein S8  100 
 
 
131 aa  268  2e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.237911  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2674  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 
132 aa  144  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.169773  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0423  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 
132 aa  140  4e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.376685  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0598  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 
132 aa  139  9e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0508893  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2980  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 
132 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1729  30S ribosomal protein S8  49.24 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0375  30S ribosomal protein S8  49.24 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2520  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0299  30S ribosomal protein S8  50.39 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.541435 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0773  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 
132 aa  131  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.590694  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0333  30S ribosomal protein S8  51.56 
 
 
131 aa  130  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000752194  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4784  30S ribosomal protein S8  47.73 
 
 
132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00859793  hitchhiker  0.0000000067379 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2150  ribosomal protein S8  48.46 
 
 
131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1932  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1368  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.380373  normal  0.0838424 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1781  SSU ribosomal protein S8P  50.38 
 
 
132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0284489  normal  0.0855864 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1339  30S ribosomal protein S8  46.56 
 
 
131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2465  ribosomal protein S8  48.46 
 
 
131 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2187  ribosomal protein S8  48.46 
 
 
131 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.966556  normal  0.921197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2204  ribosomal protein S8  47.69 
 
 
131 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184093  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1219  30S ribosomal protein S8  49.24 
 
 
132 aa  125  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1182  30S ribosomal protein S8  49.24 
 
 
132 aa  125  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.358375  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0566  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1263  30S ribosomal protein S8  46.56 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476198  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0268  30S ribosomal protein S8  48.46 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0501606  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1970  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 
132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00042719  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0605  30S ribosomal protein S8  48.46 
 
 
130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354431  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5056  ribosomal protein S8  47.69 
 
 
131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00882416  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1305  30S ribosomal protein S8  47.01 
 
 
133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08990  30S ribosomal protein S8  44.7 
 
 
130 aa  124  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000305934  normal  0.17912 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1000  30S ribosomal protein S8  47.73 
 
 
132 aa  123  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361404  normal  0.0173239 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1751  30S ribosomal protein S8  51.16 
 
 
126 aa  123  9e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327993  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4229  30S ribosomal protein S8  48.46 
 
 
131 aa  123  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00128443  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3935  ribosomal protein S8  46.92 
 
 
131 aa  123  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3303  30S ribosomal protein S8  48.46 
 
 
131 aa  122  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0633742  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0851  30S ribosomal protein S8  44.7 
 
 
189 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000583772  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3165  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
131 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000492861  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1922  ribosomal protein S8  47.69 
 
 
131 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.688198  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1664  30S ribosomal protein S8  47.73 
 
 
132 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0768138  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0334  30S ribosomal protein S8  46.92 
 
 
131 aa  121  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000103559  hitchhiker  0.000409506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3895  30S ribosomal protein S8  45.8 
 
 
130 aa  121  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000590966  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0293  SSU ribosomal protein S8P  49.23 
 
 
131 aa  121  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000301121  hitchhiker  0.00000201574 
 
 
 
NC_011901  Tgr7_2310  30S ribosomal protein S8  46.88 
 
 
131 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299124  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0615  30S ribosomal protein S8  48.46 
 
 
131 aa  121  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0938448  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2750  ribosomal protein S8  47.73 
 
 
132 aa  121  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0659049  normal  0.320849 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0339  ribosomal protein S8  46.92 
 
 
131 aa  121  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  46.21 
 
 
132 aa  121  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0341  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
131 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000242474  normal  0.012194 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0290  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
131 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000392794  normal  0.0211044 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2745  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
131 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000001061  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2825  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
131 aa  120  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00378169  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0281  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
131 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00164678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0362  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
131 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000109852  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4928  30S ribosomal protein S8  44.7 
 
 
132 aa  120  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000649182  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0712  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
132 aa  120  6e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  48.85 
 
 
131 aa  120  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  47.37 
 
 
133 aa  120  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4735  30S ribosomal protein S8  46.21 
 
 
130 aa  120  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000117347  normal  0.480985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0468  30S ribosomal protein S8  46.21 
 
 
130 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00000537928  hitchhiker  0.00000317372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3461  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
131 aa  120  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000315626  decreased coverage  0.00455507 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0501  30S ribosomal protein S8  46.21 
 
 
130 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000611084  normal  0.097534 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0498  30S ribosomal protein S8  46.21 
 
 
130 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000149249  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3010  30S ribosomal protein S8  47.76 
 
 
133 aa  120  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0643705  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0733  30S ribosomal protein S8  43.51 
 
 
130 aa  120  9e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00108537  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1840  30S ribosomal protein S8  48.44 
 
 
133 aa  119  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3429  SSU ribosomal protein S8P  46.92 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401313  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0387  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000185574  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0704  30S ribosomal protein S8  45.11 
 
 
133 aa  119  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118286  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  46.97 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  44.36 
 
 
133 aa  119  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1271  ribosomal protein S8  46.56 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1629  ribosomal protein S8  47.33 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1628  30S ribosomal protein S8  45.45 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569201  normal  0.282916 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0395  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00245288  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2311  30S ribosomal protein S8  46.92 
 
 
131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0101074  normal  0.226186 
 
 
-
 
NC_002950  PG1924  30S ribosomal protein S8  48.09 
 
 
131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1444  30S ribosomal protein S8  47.76 
 
 
132 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.18582 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3005  30S ribosomal protein S8  48.85 
 
 
131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00104823  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0263  30S ribosomal protein S8  46.92 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000657656  hitchhiker  0.00182938 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0640  ribosomal protein S8  45.45 
 
 
130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000305932  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3732  30S ribosomal protein S8  46.92 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000192873  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1938  30S ribosomal protein S8  46.92 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00217101  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2618  30S ribosomal protein S8  46.92 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00463445  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4534  30S ribosomal protein S8  45.45 
 
 
130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000327382  normal  0.123392 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3155  30S ribosomal protein S8  46.92 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0148132  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3716  30S ribosomal protein S8  45.11 
 
 
133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3762  30S ribosomal protein S8  46.92 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000826269  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  46.97 
 
 
132 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5065  30S ribosomal protein S8  44.27 
 
 
130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000451262  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2243  30S ribosomal protein S8  47.29 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0125456  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3054  30S ribosomal protein S8  46.92 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000128186  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  47.73 
 
 
132 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0489  30S ribosomal protein S8  46.15 
 
 
131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000854539  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  46.97 
 
 
132 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3790  30S ribosomal protein S8  46.92 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.19991  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1346  30S ribosomal protein S8  47.76 
 
 
132 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000055965  normal  0.0735318 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3492  30S ribosomal protein S8  46.92 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107985  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 
132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  46.15 
 
 
130 aa  118  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0419  SSU ribosomal protein S8P  48.44 
 
 
131 aa  118  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00478629  normal  0.230191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>