More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4689 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4689  ABC transporter related  100 
 
 		 331 aa  651    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1069  ABC transporter related  74.62 
 
 		 285 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5809  ABC transporter related  71.52 
 
 		 292 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2073  ABC transporter-related protein  71.6 
 
 		 276 aa  431  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111987  normal  0.868445 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2673  ABC transporter related  48.56 
 
 		 324 aa  324  1e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0190306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0444  ABC transporter related  49.54 
 
 		 324 aa  320  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2522  ABC transporter related  44.58 
 
 		 336 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1832  ABC transporter related  51.08 
 
 		 335 aa  309  4e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3780  ABC transporter related  57.61 
 
 		 265 aa  299  5e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000137492  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0526  ABC transporter related protein  45.26 
 
 		 328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1358  ABC transporter related protein  43.88 
 
 		 334 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0486  ABC transporter related  41.02 
 
 		 334 aa  276  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0660  ABC transporter related  46.46 
 
 		 337 aa  272  7e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  hitchhiker  0.000000264016 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0487  ABC transporter, ATP-binding protein  49.62 
 
 		 261 aa  271  8.000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.139587  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1189  ABC transporter related protein  42.41 
 
 		 322 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2385  ABC transporter related  48.61 
 
 		 320 aa  268  8.999999999999999e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0448  ABC transporter related  41.16 
 
 		 337 aa  267  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0537  ABC transporter, ATP-binding protein  41.16 
 
 		 337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0454  ABC transporter-related protein  41.28 
 
 		 337 aa  266  4e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1920  ABC transporter related  50.67 
 
 		 324 aa  266  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4789  ABC transporter, ATP-binding protein  41.16 
 
 		 337 aa  265  8e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0670413  hitchhiker  0.00137355 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0587  ABC transporter, ATP-binding protein  41.16 
 
 		 337 aa  263  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0515  ABC transporter, ATP-binding protein  41.16 
 
 		 337 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00155864 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0588  ABC transporter, ATP-binding protein  41.46 
 
 		 337 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0500  ABC transporter ATP-binding protein  41.16 
 
 		 337 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0443  ABC transporter, ATP-binding protein  41.16 
 
 		 337 aa  263  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0439  ABC transporter, ATP-binding protein  41.16 
 
 		 337 aa  263  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0978  ABC transporter related  39.44 
 
 		 342 aa  263  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0532  ABC transporter ATP-binding protein  41.16 
 
 		 337 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0175  ABC transporter, ATP-binding protein  38.28 
 
 		 341 aa  263  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2493  ABC transporter related protein  53.12 
 
 		 318 aa  261  8e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000144687  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0172  ABC transporter, ATP-binding protein  37.98 
 
 		 341 aa  260  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4781  ABC transporter related protein  50 
 
 		 330 aa  260  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.975884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0434  ABC transporter related  41.54 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2220  ABC transporter related  44.34 
 
 		 333 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.580066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2519  ABC transporter related  44.06 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.791521  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0659  ABC transporter, ATP-binding protein  40.49 
 
 		 330 aa  252  6e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6487  ABC transporter related  53.51 
 
 		 317 aa  251  9.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0112869  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4151  ABC transporter related protein  44.33 
 
 		 321 aa  249  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0325933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3436  ABC transporter, ATP-binding protein  56.56 
 
 		 254 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.352902 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2515  ABC transporter related  41.56 
 
 		 324 aa  246  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1128  ABC transporter related  35.62 
 
 		 328 aa  242  7e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0395401  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2682  ABC transporter-like  39.63 
 
 		 326 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.241225  normal  0.53563 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3863  ABC transporter related  36.76 
 
 		 329 aa  238  6.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1759  ABC transporter-like protein protein  42.69 
 
 		 326 aa  236  5.0000000000000005e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.984007  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3153  ABC transporter related  45.07 
 
 		 323 aa  235  8e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0404  ABC transporter, ATPase subunit  40.67 
 
 		 334 aa  235  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2818  ABC transporter related protein  45.9 
 
 		 333 aa  235  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.700865  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09750  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  47.39 
 
 		 342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2891  ABC transporter-like protein  46.31 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1396  ABC transporter related protein  36.94 
 
 		 331 aa  233  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1441  ABC transporter related protein  42.64 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2031  ABC transporter related  36.53 
 
 		 329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2057  ABC transporter related  36.53 
 
 		 329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0425  ABC transporter related protein  34.36 
 
 		 339 aa  233  5e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3407  ABC transporter related  38.48 
 
 		 336 aa  232  5e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205192 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0432  ABC transporter-related protein  40.37 
 
 		 334 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2319  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 323 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0433  ABC transporter related  40.37 
 
 		 334 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0178  ATPase  39.14 
 
 		 325 aa  229  6e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.604425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2557  ATPase  46.92 
 
 		 324 aa  228  8e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3395  ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109056  hitchhiker  0.000000258754 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2497  ABC transporter related  38.84 
 
 		 328 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.946851  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2410  ABC transporter related  41.02 
 
 		 332 aa  226  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1284  ABC transporter related  38.15 
 
 		 329 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.980121 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1966  ABC transporter related  40.67 
 
 		 324 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000391335  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3919  ABC transporter related protein  45.78 
 
 		 318 aa  226  6e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0550  ABC transporter-like protein  40.31 
 
 		 328 aa  225  8e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0536  ABC transporter related protein  40.31 
 
 		 328 aa  225  8e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4166  ABC transporter related  42.59 
 
 		 332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675613  normal  0.359967 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0911  ABC transporter related protein  34.46 
 
 		 329 aa  218  7.999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  34.57 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29121  putative multidrug efflux ABC transporter  43.07 
 
 		 331 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2211  ATPase  43.06 
 
 		 328 aa  217  2.9999999999999998e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0547  ABC transporter related  44.4 
 
 		 333 aa  217  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  33.84 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4137  ABC transporter related  45.71 
 
 		 326 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12840  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  42.27 
 
 		 341 aa  209  6e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0981  ATPase  34.45 
 
 		 331 aa  209  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425969  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  33.23 
 
 		 331 aa  208  9e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0893  ABC transporter, ATP-binding protein  37.08 
 
 		 343 aa  208  1e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2350  ABC transporter related  35.94 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09011  putative multidrug efflux ABC transporter  40 
 
 		 332 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266178 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0234  ATPase  40 
 
 		 332 aa  206  7e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.822297  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08570  ABC transporter related  35.46 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2651  ABC transporter, ATP-binding protein  29.02 
 
 		 329 aa  189  5e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0136  ABC transporter related protein  36.18 
 
 		 314 aa  178  9e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3566  ABC transporter related  38.55 
 
 		 302 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1507  ABC transporter related protein  35.17 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  decreased coverage  0.000000000014489  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.91 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.46 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  34.73 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.89 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.36 
 
 		 317 aa  151  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.32 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.31 
 
 		 317 aa  150  4e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  33.57 
 
 		 304 aa  149  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  35.62 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  37.04 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  41.31 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>