More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3407 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3407  ABC transporter related  100 
 
 
336 aa  681    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.205192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2497  ABC transporter related  73.87 
 
 
328 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.946851  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2682  ABC transporter-like  72.81 
 
 
326 aa  503  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.241225  normal  0.53563 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2031  ABC transporter related  72.42 
 
 
329 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2057  ABC transporter related  72.12 
 
 
329 aa  494  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1284  ABC transporter related  70.39 
 
 
329 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.980121 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1759  ABC transporter-like protein protein  70.09 
 
 
326 aa  487  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.984007  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2818  ABC transporter related protein  65.27 
 
 
333 aa  452  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.700865  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0178  ATPase  65.85 
 
 
325 aa  454  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.604425  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2891  ABC transporter-like protein  65.44 
 
 
330 aa  446  1.0000000000000001e-124  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29121  putative multidrug efflux ABC transporter  62.5 
 
 
331 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2557  ATPase  61.59 
 
 
324 aa  405  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2211  ATPase  60.37 
 
 
328 aa  395  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0234  ATPase  57.75 
 
 
332 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.822297  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09011  putative multidrug efflux ABC transporter  58.23 
 
 
332 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2515  ABC transporter related  54.94 
 
 
324 aa  359  4e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0981  ATPase  51.99 
 
 
331 aa  341  8e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425969  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  50.15 
 
 
331 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  48.93 
 
 
329 aa  336  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  48.47 
 
 
331 aa  334  1e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1441  ABC transporter related protein  51.53 
 
 
326 aa  323  2e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1966  ABC transporter related  48.04 
 
 
324 aa  317  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000391335  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2319  ABC transporter related protein  48 
 
 
323 aa  315  5e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0432  ABC transporter-related protein  47.4 
 
 
334 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0404  ABC transporter, ATPase subunit  47.4 
 
 
334 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0433  ABC transporter related  47.4 
 
 
334 aa  311  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0660  ABC transporter related  47.72 
 
 
337 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  hitchhiker  0.000000264016 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4166  ABC transporter related  48.34 
 
 
332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675613  normal  0.359967 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1396  ABC transporter related protein  43.67 
 
 
331 aa  290  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2350  ABC transporter related  42.77 
 
 
324 aa  281  8.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2410  ABC transporter related  43.58 
 
 
332 aa  278  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3395  ABC transporter, ATP-binding protein  41.85 
 
 
338 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109056  hitchhiker  0.000000258754 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0588  ABC transporter, ATP-binding protein  38.92 
 
 
337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0537  ABC transporter, ATP-binding protein  38.99 
 
 
337 aa  269  5e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4789  ABC transporter, ATP-binding protein  38.55 
 
 
337 aa  268  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0670413  hitchhiker  0.00137355 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0587  ABC transporter, ATP-binding protein  38.62 
 
 
337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0500  ABC transporter ATP-binding protein  38.62 
 
 
337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0443  ABC transporter, ATP-binding protein  38.62 
 
 
337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0439  ABC transporter, ATP-binding protein  38.62 
 
 
337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0532  ABC transporter ATP-binding protein  38.62 
 
 
337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0448  ABC transporter related  38.89 
 
 
337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0515  ABC transporter, ATP-binding protein  38.62 
 
 
337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00155864 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0526  ABC transporter related protein  41.09 
 
 
328 aa  265  5.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0454  ABC transporter-related protein  37.65 
 
 
337 aa  263  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1358  ABC transporter related protein  40.54 
 
 
334 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0434  ABC transporter related  38.97 
 
 
336 aa  258  8e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0893  ABC transporter, ATP-binding protein  47.15 
 
 
343 aa  257  2e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1832  ABC transporter related  40.84 
 
 
335 aa  256  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0486  ABC transporter related  36.83 
 
 
334 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0978  ABC transporter related  36.64 
 
 
342 aa  249  5e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2522  ABC transporter related  35.95 
 
 
336 aa  249  6e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0659  ABC transporter, ATP-binding protein  38.1 
 
 
330 aa  245  8e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4781  ABC transporter related protein  41.37 
 
 
330 aa  242  7e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.975884 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0911  ABC transporter related protein  37.58 
 
 
329 aa  242  7e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3863  ABC transporter related  37.2 
 
 
329 aa  241  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0172  ABC transporter, ATP-binding protein  36.23 
 
 
341 aa  240  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0175  ABC transporter, ATP-binding protein  35.65 
 
 
341 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3780  ABC transporter related  43.8 
 
 
265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000137492  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1189  ABC transporter related protein  37.2 
 
 
322 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0444  ABC transporter related  37.46 
 
 
324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4689  ABC transporter related  38.48 
 
 
331 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2493  ABC transporter related protein  43.96 
 
 
318 aa  230  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000144687  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1069  ABC transporter related  44.67 
 
 
285 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1128  ABC transporter related  35.87 
 
 
328 aa  229  5e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0395401  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3436  ABC transporter, ATP-binding protein  50.47 
 
 
254 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.352902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2385  ABC transporter related  39.02 
 
 
320 aa  227  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2073  ABC transporter-related protein  43.65 
 
 
276 aa  226  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111987  normal  0.868445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1920  ABC transporter related  38.94 
 
 
324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567782  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5809  ABC transporter related  44.67 
 
 
292 aa  225  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2519  ABC transporter related  36.83 
 
 
333 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.791521  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2673  ABC transporter related  42.02 
 
 
324 aa  224  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0190306  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2220  ABC transporter related  36.26 
 
 
333 aa  222  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.580066  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0547  ABC transporter related  40.31 
 
 
333 aa  222  7e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0487  ABC transporter, ATP-binding protein  41 
 
 
261 aa  221  1.9999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.139587  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3919  ABC transporter related protein  38.71 
 
 
318 aa  219  6e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4151  ABC transporter related protein  35.95 
 
 
321 aa  217  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0325933 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0536  ABC transporter related protein  34.85 
 
 
328 aa  216  5.9999999999999996e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0550  ABC transporter-like protein  34.85 
 
 
328 aa  216  5.9999999999999996e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0425  ABC transporter related protein  35.01 
 
 
339 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6487  ABC transporter related  41.83 
 
 
317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0112869  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3153  ABC transporter related  35.88 
 
 
323 aa  209  5e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148075  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09750  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  38.23 
 
 
342 aa  204  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4137  ABC transporter related  41.11 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12840  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  41.74 
 
 
341 aa  197  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1507  ABC transporter related protein  35.32 
 
 
314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  decreased coverage  0.000000000014489  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.37 
 
 
317 aa  171  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3566  ABC transporter related  37.44 
 
 
302 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.23 
 
 
316 aa  169  4e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0136  ABC transporter related protein  33.09 
 
 
314 aa  167  2e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.36 
 
 
317 aa  165  8e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.53 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08570  ABC transporter related  31.18 
 
 
262 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2651  ABC transporter, ATP-binding protein  29.24 
 
 
329 aa  157  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.93 
 
 
330 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  37.97 
 
 
303 aa  152  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  35.37 
 
 
306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  37.55 
 
 
339 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  37.55 
 
 
339 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0789  ABC transporter related  37.33 
 
 
360 aa  149  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3319  ABC transporter related  32.61 
 
 
332 aa  149  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>