More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12840 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_12840  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  100 
 
 		 341 aa  661    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3153  ABC transporter related  70 
 
 		 323 aa  437  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4137  ABC transporter related  62.91 
 
 		 326 aa  334  1e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3919  ABC transporter related protein  56.59 
 
 		 318 aa  333  3e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6487  ABC transporter related  56.59 
 
 		 317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0112869  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09750  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  53.29 
 
 		 342 aa  312  5.999999999999999e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4781  ABC transporter related protein  52.98 
 
 		 330 aa  300  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.975884 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1832  ABC transporter related  49.28 
 
 		 335 aa  299  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0526  ABC transporter related protein  44.31 
 
 		 328 aa  291  9e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2385  ABC transporter related  49.41 
 
 		 320 aa  288  8e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4151  ABC transporter related protein  47.9 
 
 		 321 aa  288  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0325933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2493  ABC transporter related protein  52.08 
 
 		 318 aa  275  8e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000144687  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0659  ABC transporter, ATP-binding protein  39.77 
 
 		 330 aa  272  5.000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1920  ABC transporter related  47.04 
 
 		 324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2522  ABC transporter related  37.71 
 
 		 336 aa  268  8.999999999999999e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0172  ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 		 341 aa  265  8e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0175  ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 		 341 aa  263  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1358  ABC transporter related protein  42.69 
 
 		 334 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0486  ABC transporter related  40.64 
 
 		 334 aa  258  8e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0587  ABC transporter, ATP-binding protein  39.65 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0537  ABC transporter, ATP-binding protein  39.65 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0500  ABC transporter ATP-binding protein  39.65 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0443  ABC transporter, ATP-binding protein  39.65 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0439  ABC transporter, ATP-binding protein  39.65 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0532  ABC transporter ATP-binding protein  39.65 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0454  ABC transporter-related protein  39.31 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0515  ABC transporter, ATP-binding protein  39.65 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00155864 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0448  ABC transporter related  39.65 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0588  ABC transporter, ATP-binding protein  39.65 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4789  ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0670413  hitchhiker  0.00137355 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2220  ABC transporter related  42.11 
 
 		 333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.580066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2673  ABC transporter related  39.47 
 
 		 324 aa  250  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0190306  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2519  ABC transporter related  42.11 
 
 		 333 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.791521  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3436  ABC transporter, ATP-binding protein  57.58 
 
 		 254 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.352902 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0434  ABC transporter related  38.3 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0978  ABC transporter related  35.84 
 
 		 342 aa  247  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3780  ABC transporter related  46.28 
 
 		 265 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000137492  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0425  ABC transporter related protein  33.73 
 
 		 339 aa  231  1e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0487  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 261 aa  231  2e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.139587  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2410  ABC transporter related  40.17 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0444  ABC transporter related  37.13 
 
 		 324 aa  225  8e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4689  ABC transporter related  42.27 
 
 		 331 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1189  ABC transporter related protein  33.63 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0433  ABC transporter related  40.4 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0404  ABC transporter, ATPase subunit  39.18 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0432  ABC transporter-related protein  39.83 
 
 		 334 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2350  ABC transporter related  39.22 
 
 		 324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1284  ABC transporter related  37.14 
 
 		 329 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.980121 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2557  ATPase  39.18 
 
 		 324 aa  215  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0660  ABC transporter related  39.5 
 
 		 337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  hitchhiker  0.000000264016 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2031  ABC transporter related  34.99 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1128  ABC transporter related  41.32 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0395401  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2057  ABC transporter related  34.99 
 
 		 329 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1441  ABC transporter related protein  38.01 
 
 		 326 aa  210  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  39.83 
 
 		 331 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2211  ATPase  45.38 
 
 		 328 aa  208  1e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1396  ABC transporter related protein  34.21 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3407  ABC transporter related  34.59 
 
 		 336 aa  205  8e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205192 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2319  ABC transporter related protein  35.84 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0550  ABC transporter-like protein  38.48 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1069  ABC transporter related  47.41 
 
 		 285 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2682  ABC transporter-like  35.67 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.241225  normal  0.53563 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0536  ABC transporter related protein  38.48 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3863  ABC transporter related  32.08 
 
 		 329 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2073  ABC transporter-related protein  50.9 
 
 		 276 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111987  normal  0.868445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2497  ABC transporter related  37.42 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.946851  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  38.17 
 
 		 331 aa  203  3e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2515  ABC transporter related  36.36 
 
 		 324 aa  203  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0981  ATPase  39 
 
 		 331 aa  202  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425969  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08570  ABC transporter related  34.93 
 
 		 262 aa  202  9e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2818  ABC transporter related protein  35.47 
 
 		 333 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.700865  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1966  ABC transporter related  36.15 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000391335  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0178  ATPase  36.51 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.604425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0547  ABC transporter related  37.9 
 
 		 333 aa  199  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5809  ABC transporter related  47.62 
 
 		 292 aa  199  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0234  ATPase  35.76 
 
 		 332 aa  198  9e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.822297  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  30.7 
 
 		 329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09011  putative multidrug efflux ABC transporter  36.34 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266178 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2891  ABC transporter-like protein  43.23 
 
 		 330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29121  putative multidrug efflux ABC transporter  35.96 
 
 		 331 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4166  ABC transporter related  38.86 
 
 		 332 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675613  normal  0.359967 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1759  ABC transporter-like protein protein  41.05 
 
 		 326 aa  192  8e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.984007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3395  ABC transporter, ATP-binding protein  30.5 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109056  hitchhiker  0.000000258754 
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1507  ABC transporter related protein  37.34 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  decreased coverage  0.000000000014489  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0136  ABC transporter related protein  35.42 
 
 		 314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0911  ABC transporter related protein  29.15 
 
 		 329 aa  179  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2651  ABC transporter, ATP-binding protein  29.22 
 
 		 329 aa  179  4.999999999999999e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0893  ABC transporter, ATP-binding protein  28.53 
 
 		 343 aa  176  6e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3566  ABC transporter related  38 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0789  ABC transporter related  36.82 
 
 		 360 aa  146  6e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.45 
 
 		 330 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2329  ABC transporter-like protein  36.28 
 
 		 301 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.613206 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  31.19 
 
 		 243 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  31.19 
 
 		 243 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0768  ABC transporter related protein  34.86 
 
 		 255 aa  136  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2275  ABC transporter related protein  35.86 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0129  ABC transporter related  37.25 
 
 		 264 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.03 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.45 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3319  ABC transporter related  28.02 
 
 		 332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>