More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2220 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2220  ABC transporter related  100 
 
 
333 aa  670    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.580066  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2519  ABC transporter related  93.69 
 
 
333 aa  631  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.791521  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2522  ABC transporter related  44.41 
 
 
336 aa  324  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1832  ABC transporter related  49.85 
 
 
335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0526  ABC transporter related protein  46.6 
 
 
328 aa  317  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2385  ABC transporter related  51.39 
 
 
320 aa  301  8.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1920  ABC transporter related  51.84 
 
 
324 aa  297  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567782  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0978  ABC transporter related  44.01 
 
 
342 aa  296  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0172  ABC transporter, ATP-binding protein  44.57 
 
 
341 aa  296  4e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0175  ABC transporter, ATP-binding protein  44.15 
 
 
341 aa  292  5e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0448  ABC transporter related  42.3 
 
 
337 aa  290  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0537  ABC transporter, ATP-binding protein  41.92 
 
 
337 aa  289  6e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0587  ABC transporter, ATP-binding protein  42.3 
 
 
337 aa  287  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0500  ABC transporter ATP-binding protein  42.3 
 
 
337 aa  287  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0443  ABC transporter, ATP-binding protein  42.3 
 
 
337 aa  287  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0439  ABC transporter, ATP-binding protein  42.3 
 
 
337 aa  287  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0532  ABC transporter ATP-binding protein  42.3 
 
 
337 aa  287  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0515  ABC transporter, ATP-binding protein  42.3 
 
 
337 aa  287  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00155864 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0588  ABC transporter, ATP-binding protein  42.3 
 
 
337 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0454  ABC transporter-related protein  42.64 
 
 
337 aa  287  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4789  ABC transporter, ATP-binding protein  41.99 
 
 
337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0670413  hitchhiker  0.00137355 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0486  ABC transporter related  43.87 
 
 
334 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1358  ABC transporter related protein  44.31 
 
 
334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0434  ABC transporter related  42.25 
 
 
336 aa  282  4.0000000000000003e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2673  ABC transporter related  43.83 
 
 
324 aa  278  9e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0190306  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4151  ABC transporter related protein  45.29 
 
 
321 aa  277  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0325933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6487  ABC transporter related  48.92 
 
 
317 aa  275  7e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0112869  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3780  ABC transporter related  54.51 
 
 
265 aa  273  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000137492  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0659  ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 
330 aa  272  5.000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3153  ABC transporter related  50.51 
 
 
323 aa  267  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148075  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2493  ABC transporter related protein  50.34 
 
 
318 aa  265  8e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000144687  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0911  ABC transporter related protein  39.56 
 
 
329 aa  262  6.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4781  ABC transporter related protein  48.1 
 
 
330 aa  262  8e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.975884 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0444  ABC transporter related  42.11 
 
 
324 aa  258  7e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3863  ABC transporter related  38.23 
 
 
329 aa  256  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4689  ABC transporter related  44.34 
 
 
331 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3919  ABC transporter related protein  43.87 
 
 
318 aa  256  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0404  ABC transporter, ATPase subunit  38.53 
 
 
334 aa  255  9e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0432  ABC transporter-related protein  38.23 
 
 
334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2515  ABC transporter related  40.06 
 
 
324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0433  ABC transporter related  38.23 
 
 
334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09750  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  48.55 
 
 
342 aa  251  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2073  ABC transporter-related protein  50.6 
 
 
276 aa  250  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111987  normal  0.868445 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1069  ABC transporter related  51.64 
 
 
285 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0487  ABC transporter, ATP-binding protein  48.15 
 
 
261 aa  249  6e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.139587  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0547  ABC transporter related  42.3 
 
 
333 aa  247  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1189  ABC transporter related protein  38.58 
 
 
322 aa  246  6e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5809  ABC transporter related  50.62 
 
 
292 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3436  ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 
254 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.352902 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1128  ABC transporter related  37.15 
 
 
328 aa  241  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0395401  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2891  ABC transporter-like protein  41.67 
 
 
330 aa  240  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12840  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  42.4 
 
 
341 aa  239  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2410  ABC transporter related  38.02 
 
 
332 aa  237  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2682  ABC transporter-like  38.53 
 
 
326 aa  237  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.241225  normal  0.53563 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0425  ABC transporter related protein  36.72 
 
 
339 aa  236  3e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2557  ATPase  40 
 
 
324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4166  ABC transporter related  38.25 
 
 
332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675613  normal  0.359967 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4137  ABC transporter related  47.35 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2818  ABC transporter related protein  38.25 
 
 
333 aa  233  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.700865  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1284  ABC transporter related  38.53 
 
 
329 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.980121 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09011  putative multidrug efflux ABC transporter  38.12 
 
 
332 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266178 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1966  ABC transporter related  39.26 
 
 
324 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000391335  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0234  ATPase  38.12 
 
 
332 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.822297  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1396  ABC transporter related protein  37.54 
 
 
331 aa  228  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2211  ATPase  38.79 
 
 
328 aa  228  1e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3395  ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 
338 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109056  hitchhiker  0.000000258754 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2319  ABC transporter related protein  38.79 
 
 
323 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1441  ABC transporter related protein  38.24 
 
 
326 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08570  ABC transporter related  38.43 
 
 
262 aa  224  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  35.44 
 
 
331 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3407  ABC transporter related  36.26 
 
 
336 aa  222  6e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.205192 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29121  putative multidrug efflux ABC transporter  38.3 
 
 
331 aa  221  9e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2057  ABC transporter related  37.16 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2350  ABC transporter related  42.02 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2031  ABC transporter related  37.05 
 
 
329 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  34.49 
 
 
331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0536  ABC transporter related protein  37.16 
 
 
328 aa  220  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0550  ABC transporter-like protein  37.16 
 
 
328 aa  220  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0981  ATPase  34.49 
 
 
331 aa  219  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425969  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0660  ABC transporter related  36.17 
 
 
337 aa  219  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  hitchhiker  0.000000264016 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0178  ATPase  37.65 
 
 
325 aa  218  8.999999999999998e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.604425  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  35.44 
 
 
329 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1759  ABC transporter-like protein protein  35.98 
 
 
326 aa  216  5e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.984007  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2497  ABC transporter related  37.8 
 
 
328 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.946851  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0893  ABC transporter, ATP-binding protein  31.29 
 
 
343 aa  202  5e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1507  ABC transporter related protein  38.91 
 
 
314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  decreased coverage  0.000000000014489  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3566  ABC transporter related  39.57 
 
 
302 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0136  ABC transporter related protein  41.75 
 
 
314 aa  188  9e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2651  ABC transporter, ATP-binding protein  29.57 
 
 
329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  37.33 
 
 
266 aa  155  8e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.19 
 
 
339 aa  154  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.11 
 
 
328 aa  151  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  36.71 
 
 
327 aa  150  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.17 
 
 
334 aa  149  9e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.7 
 
 
343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.85 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.1 
 
 
323 aa  146  5e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0785  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.85 
 
 
324 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.09 
 
 
324 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.29 
 
 
324 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>