More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4137 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4137  ABC transporter related  100 
 
 		 326 aa  620  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3153  ABC transporter related  67.1 
 
 		 323 aa  382  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3919  ABC transporter related protein  64.49 
 
 		 318 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12840  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  62.91 
 
 		 341 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09750  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  63.29 
 
 		 342 aa  338  7e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6487  ABC transporter related  59.37 
 
 		 317 aa  318  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0112869  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2522  ABC transporter related  43.65 
 
 		 336 aa  312  3.9999999999999997e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1832  ABC transporter related  51.23 
 
 		 335 aa  311  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4781  ABC transporter related protein  55.97 
 
 		 330 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.975884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4151  ABC transporter related protein  51.41 
 
 		 321 aa  302  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0325933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0526  ABC transporter related protein  46.77 
 
 		 328 aa  300  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2385  ABC transporter related  52.85 
 
 		 320 aa  299  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2493  ABC transporter related protein  58.28 
 
 		 318 aa  295  8e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000144687  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1920  ABC transporter related  51.26 
 
 		 324 aa  282  6.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3436  ABC transporter, ATP-binding protein  61.68 
 
 		 254 aa  269  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.352902 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0175  ABC transporter, ATP-binding protein  38.28 
 
 		 341 aa  265  7e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0172  ABC transporter, ATP-binding protein  38.28 
 
 		 341 aa  265  7e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0454  ABC transporter-related protein  41.82 
 
 		 337 aa  262  6e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0434  ABC transporter related  42.28 
 
 		 336 aa  259  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0448  ABC transporter related  41.21 
 
 		 337 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0587  ABC transporter, ATP-binding protein  41.21 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0500  ABC transporter ATP-binding protein  41.21 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0443  ABC transporter, ATP-binding protein  41.21 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0439  ABC transporter, ATP-binding protein  41.21 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0532  ABC transporter ATP-binding protein  41.21 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0588  ABC transporter, ATP-binding protein  41.21 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0515  ABC transporter, ATP-binding protein  41.21 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00155864 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4789  ABC transporter, ATP-binding protein  41.21 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0670413  hitchhiker  0.00137355 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0537  ABC transporter, ATP-binding protein  41.21 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0486  ABC transporter related  43.46 
 
 		 334 aa  256  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2220  ABC transporter related  47.4 
 
 		 333 aa  255  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.580066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2519  ABC transporter related  47.06 
 
 		 333 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.791521  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2673  ABC transporter related  41.67 
 
 		 324 aa  252  8.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0190306  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0660  ABC transporter related  45.82 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  hitchhiker  0.000000264016 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1189  ABC transporter related protein  37.27 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0659  ABC transporter, ATP-binding protein  39.51 
 
 		 330 aa  246  3e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1358  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 334 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0978  ABC transporter related  39.24 
 
 		 342 aa  246  4e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4689  ABC transporter related  46.63 
 
 		 331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1284  ABC transporter related  43.05 
 
 		 329 aa  238  9e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.980121 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3863  ABC transporter related  34.46 
 
 		 329 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2057  ABC transporter related  39.75 
 
 		 329 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2031  ABC transporter related  38.75 
 
 		 329 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1441  ABC transporter related protein  45.58 
 
 		 326 aa  233  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0425  ABC transporter related protein  35.29 
 
 		 339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2557  ATPase  43.85 
 
 		 324 aa  229  6e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0547  ABC transporter related  46.62 
 
 		 333 aa  229  6e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1396  ABC transporter related protein  39.75 
 
 		 331 aa  228  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2410  ABC transporter related  42.07 
 
 		 332 aa  226  4e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2515  ABC transporter related  40.48 
 
 		 324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3407  ABC transporter related  41.41 
 
 		 336 aa  225  7e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205192 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3780  ABC transporter related  48.65 
 
 		 265 aa  224  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000137492  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2350  ABC transporter related  44.12 
 
 		 324 aa  222  8e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0487  ABC transporter, ATP-binding protein  44.03 
 
 		 261 aa  221  1.9999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.139587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5809  ABC transporter related  54.81 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0911  ABC transporter related protein  34.56 
 
 		 329 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0444  ABC transporter related  43.26 
 
 		 324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2891  ABC transporter-like protein  41.37 
 
 		 330 aa  219  5e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1069  ABC transporter related  51.57 
 
 		 285 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2682  ABC transporter-like  39.38 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.241225  normal  0.53563 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2497  ABC transporter related  40.18 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.946851  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1759  ABC transporter-like protein protein  40.88 
 
 		 326 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.984007  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2818  ABC transporter related protein  46.52 
 
 		 333 aa  216  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.700865  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08570  ABC transporter related  36.9 
 
 		 262 aa  216  5e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1128  ABC transporter related  36.13 
 
 		 328 aa  216  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0395401  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0404  ABC transporter, ATPase subunit  43.96 
 
 		 334 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2073  ABC transporter-related protein  51.6 
 
 		 276 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111987  normal  0.868445 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0432  ABC transporter-related protein  41.56 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2211  ATPase  41.34 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0178  ATPase  40.99 
 
 		 325 aa  209  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.604425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0433  ABC transporter related  41.23 
 
 		 334 aa  208  8e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  33.68 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  34.71 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0234  ATPase  41.98 
 
 		 332 aa  205  7e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.822297  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2319  ABC transporter related protein  42.81 
 
 		 323 aa  205  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09011  putative multidrug efflux ABC transporter  41.98 
 
 		 332 aa  205  9e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266178 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1966  ABC transporter related  39.52 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000391335  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  32.08 
 
 		 329 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29121  putative multidrug efflux ABC transporter  39.25 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0981  ATPase  34.02 
 
 		 331 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425969  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4166  ABC transporter related  43.89 
 
 		 332 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675613  normal  0.359967 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3395  ABC transporter, ATP-binding protein  32.82 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109056  hitchhiker  0.000000258754 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0536  ABC transporter related protein  40.73 
 
 		 328 aa  195  7e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0550  ABC transporter-like protein  40.73 
 
 		 328 aa  195  7e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1507  ABC transporter related protein  32.74 
 
 		 314 aa  190  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  decreased coverage  0.000000000014489  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0893  ABC transporter, ATP-binding protein  29.31 
 
 		 343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0136  ABC transporter related protein  29.69 
 
 		 314 aa  186  5e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2651  ABC transporter, ATP-binding protein  28.18 
 
 		 329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3566  ABC transporter related  38.79 
 
 		 302 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3319  ABC transporter related  32.72 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  34.27 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1136  ABC transporter related  33.13 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  33.77 
 
 		 241 aa  151  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  33.33 
 
 		 243 aa  149  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.26 
 
 		 330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.6 
 
 		 324 aa  143  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  35.11 
 
 		 319 aa  142  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0789  ABC transporter related  36.53 
 
 		 360 aa  141  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0424  ABC transporter related  34.97 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>