More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_29121 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_29121  putative multidrug efflux ABC transporter  100 
 
 
331 aa  672    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09011  putative multidrug efflux ABC transporter  73.31 
 
 
332 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266178 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0234  ATPase  73.01 
 
 
332 aa  500  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.822297  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2211  ATPase  74.07 
 
 
328 aa  480  1e-134  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2557  ATPase  74.38 
 
 
324 aa  480  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2497  ABC transporter related  66.46 
 
 
328 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.946851  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2057  ABC transporter related  62.54 
 
 
329 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2031  ABC transporter related  62.54 
 
 
329 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2682  ABC transporter-like  63.69 
 
 
326 aa  418  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.241225  normal  0.53563 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0178  ATPase  63.89 
 
 
325 aa  420  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.604425  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1759  ABC transporter-like protein protein  62.11 
 
 
326 aa  417  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.984007  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2818  ABC transporter related protein  63.98 
 
 
333 aa  414  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.700865  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1284  ABC transporter related  62.65 
 
 
329 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.980121 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3407  ABC transporter related  62.5 
 
 
336 aa  410  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.205192 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2891  ABC transporter-like protein  61.73 
 
 
330 aa  401  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  53.82 
 
 
331 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  51.54 
 
 
331 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  50.76 
 
 
329 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0981  ATPase  53.21 
 
 
331 aa  361  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425969  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2515  ABC transporter related  55.03 
 
 
324 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0432  ABC transporter-related protein  51.38 
 
 
334 aa  328  9e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0660  ABC transporter related  51.71 
 
 
337 aa  328  9e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  hitchhiker  0.000000264016 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0433  ABC transporter related  51.38 
 
 
334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0404  ABC transporter, ATPase subunit  50.61 
 
 
334 aa  325  7e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1966  ABC transporter related  49.85 
 
 
324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000391335  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2319  ABC transporter related protein  48.92 
 
 
323 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4166  ABC transporter related  50.61 
 
 
332 aa  316  4e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675613  normal  0.359967 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1441  ABC transporter related protein  50.62 
 
 
326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1396  ABC transporter related protein  46.25 
 
 
331 aa  294  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2410  ABC transporter related  44.55 
 
 
332 aa  281  8.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2350  ABC transporter related  42.99 
 
 
324 aa  280  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3395  ABC transporter, ATP-binding protein  40.5 
 
 
338 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109056  hitchhiker  0.000000258754 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0911  ABC transporter related protein  36.89 
 
 
329 aa  252  5.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0434  ABC transporter related  38.08 
 
 
336 aa  252  6e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1189  ABC transporter related protein  38.01 
 
 
322 aa  249  5e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3863  ABC transporter related  36 
 
 
329 aa  246  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0486  ABC transporter related  37.46 
 
 
334 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0537  ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 
337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1358  ABC transporter related protein  38.37 
 
 
334 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4789  ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 
337 aa  242  7e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0670413  hitchhiker  0.00137355 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0448  ABC transporter related  35.45 
 
 
337 aa  242  7e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2673  ABC transporter related  37.27 
 
 
324 aa  241  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0190306  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0587  ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 
337 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0500  ABC transporter ATP-binding protein  35.45 
 
 
337 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0443  ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 
337 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0439  ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 
337 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1832  ABC transporter related  39.94 
 
 
335 aa  240  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0532  ABC transporter ATP-binding protein  35.45 
 
 
337 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0588  ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 
337 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0515  ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 
337 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00155864 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0659  ABC transporter, ATP-binding protein  36.31 
 
 
330 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0526  ABC transporter related protein  39.01 
 
 
328 aa  239  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0454  ABC transporter-related protein  35.54 
 
 
337 aa  238  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0978  ABC transporter related  33.53 
 
 
342 aa  233  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4781  ABC transporter related protein  41.37 
 
 
330 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.975884 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0175  ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 
341 aa  229  5e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0444  ABC transporter related  38.21 
 
 
324 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2522  ABC transporter related  33.44 
 
 
336 aa  228  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0547  ABC transporter related  42.28 
 
 
333 aa  227  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0172  ABC transporter, ATP-binding protein  33.73 
 
 
341 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2493  ABC transporter related protein  43.99 
 
 
318 aa  226  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000144687  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1920  ABC transporter related  38.65 
 
 
324 aa  226  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567782  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1128  ABC transporter related  33.33 
 
 
328 aa  223  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0395401  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3780  ABC transporter related  43.39 
 
 
265 aa  223  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000137492  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0893  ABC transporter, ATP-binding protein  42.55 
 
 
343 aa  221  9e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2519  ABC transporter related  37.69 
 
 
333 aa  221  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.791521  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2220  ABC transporter related  38.3 
 
 
333 aa  221  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.580066  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2385  ABC transporter related  38.87 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0487  ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 
261 aa  219  6e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.139587  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3436  ABC transporter, ATP-binding protein  47.7 
 
 
254 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.352902 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2073  ABC transporter-related protein  44.22 
 
 
276 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111987  normal  0.868445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4689  ABC transporter related  43.07 
 
 
331 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3919  ABC transporter related protein  40.45 
 
 
318 aa  215  8e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1069  ABC transporter related  45.23 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4151  ABC transporter related protein  40.54 
 
 
321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0325933 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5809  ABC transporter related  46.28 
 
 
292 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0536  ABC transporter related protein  35.67 
 
 
328 aa  207  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0550  ABC transporter-like protein  35.67 
 
 
328 aa  207  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6487  ABC transporter related  41.61 
 
 
317 aa  202  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0112869  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3153  ABC transporter related  36.51 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148075  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0425  ABC transporter related protein  39.52 
 
 
339 aa  196  7e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12840  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  42.97 
 
 
341 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09750  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39.02 
 
 
342 aa  188  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1507  ABC transporter related protein  34.15 
 
 
314 aa  177  3e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  decreased coverage  0.000000000014489  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4137  ABC transporter related  40.43 
 
 
326 aa  175  8e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0136  ABC transporter related protein  31.32 
 
 
314 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3566  ABC transporter related  39.19 
 
 
302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2651  ABC transporter, ATP-binding protein  30.93 
 
 
329 aa  161  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.28 
 
 
316 aa  161  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08570  ABC transporter related  32.82 
 
 
262 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.97 
 
 
317 aa  157  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.3 
 
 
317 aa  157  3e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  40.69 
 
 
541 aa  154  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3319  ABC transporter related  38.57 
 
 
332 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.9 
 
 
317 aa  150  4e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.33 
 
 
339 aa  150  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  40.95 
 
 
339 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  40.95 
 
 
339 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  33.97 
 
 
243 aa  149  9e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  36.52 
 
 
325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>