More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1920 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1920  ABC transporter related  100 
 
 
324 aa  644    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567782  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2385  ABC transporter related  63.14 
 
 
320 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4781  ABC transporter related protein  59.49 
 
 
330 aa  356  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.975884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2493  ABC transporter related protein  61.08 
 
 
318 aa  353  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000144687  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1832  ABC transporter related  51.67 
 
 
335 aa  331  8e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2522  ABC transporter related  48.24 
 
 
336 aa  317  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0526  ABC transporter related protein  53.95 
 
 
328 aa  317  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4151  ABC transporter related protein  52.98 
 
 
321 aa  316  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0325933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3436  ABC transporter, ATP-binding protein  65.53 
 
 
254 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.352902 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2220  ABC transporter related  51.84 
 
 
333 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.580066  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2519  ABC transporter related  50.92 
 
 
333 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.791521  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6487  ABC transporter related  53.33 
 
 
317 aa  291  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0112869  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3919  ABC transporter related protein  49.38 
 
 
318 aa  288  8e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1358  ABC transporter related protein  44.65 
 
 
334 aa  285  7e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2673  ABC transporter related  45 
 
 
324 aa  282  6.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0190306  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0486  ABC transporter related  41.77 
 
 
334 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0434  ABC transporter related  44 
 
 
336 aa  279  6e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0448  ABC transporter related  42.12 
 
 
337 aa  278  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0454  ABC transporter-related protein  41.82 
 
 
337 aa  276  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0537  ABC transporter, ATP-binding protein  42.12 
 
 
337 aa  277  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0587  ABC transporter, ATP-binding protein  42.12 
 
 
337 aa  276  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0500  ABC transporter ATP-binding protein  42.12 
 
 
337 aa  276  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0443  ABC transporter, ATP-binding protein  42.12 
 
 
337 aa  276  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0439  ABC transporter, ATP-binding protein  42.12 
 
 
337 aa  276  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0515  ABC transporter, ATP-binding protein  42.12 
 
 
337 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00155864 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0532  ABC transporter ATP-binding protein  42.12 
 
 
337 aa  276  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0588  ABC transporter, ATP-binding protein  42.12 
 
 
337 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4789  ABC transporter, ATP-binding protein  42.12 
 
 
337 aa  276  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0670413  hitchhiker  0.00137355 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3153  ABC transporter related  49.21 
 
 
323 aa  276  4e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148075  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0172  ABC transporter, ATP-binding protein  38.28 
 
 
341 aa  273  3e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0175  ABC transporter, ATP-binding protein  37.98 
 
 
341 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0444  ABC transporter related  41.85 
 
 
324 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4689  ABC transporter related  50.67 
 
 
331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0978  ABC transporter related  41.18 
 
 
342 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4137  ABC transporter related  50.31 
 
 
326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12840  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  47.01 
 
 
341 aa  264  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0659  ABC transporter, ATP-binding protein  40.12 
 
 
330 aa  261  2e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09750  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  48.57 
 
 
342 aa  258  7e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3780  ABC transporter related  51.44 
 
 
265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000137492  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1284  ABC transporter related  40.99 
 
 
329 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.980121 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1189  ABC transporter related protein  40.06 
 
 
322 aa  251  8.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0660  ABC transporter related  45.27 
 
 
337 aa  249  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  hitchhiker  0.000000264016 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2515  ABC transporter related  38.87 
 
 
324 aa  244  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0487  ABC transporter, ATP-binding protein  47.54 
 
 
261 aa  243  3e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.139587  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2557  ATPase  41.85 
 
 
324 aa  243  3e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5809  ABC transporter related  57.28 
 
 
292 aa  243  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3863  ABC transporter related  36.78 
 
 
329 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1069  ABC transporter related  52.63 
 
 
285 aa  242  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08570  ABC transporter related  41.73 
 
 
262 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2891  ABC transporter-like protein  42.02 
 
 
330 aa  241  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1441  ABC transporter related protein  41.77 
 
 
326 aa  240  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2073  ABC transporter-related protein  51.42 
 
 
276 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111987  normal  0.868445 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2057  ABC transporter related  37.84 
 
 
329 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2031  ABC transporter related  37.84 
 
 
329 aa  238  8e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0425  ABC transporter related protein  44.07 
 
 
339 aa  238  9e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0911  ABC transporter related protein  35.31 
 
 
329 aa  235  6e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2319  ABC transporter related protein  42.81 
 
 
323 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2682  ABC transporter-like  38.75 
 
 
326 aa  233  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.241225  normal  0.53563 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29121  putative multidrug efflux ABC transporter  38.65 
 
 
331 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2211  ATPase  40.31 
 
 
328 aa  229  4e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3407  ABC transporter related  38.94 
 
 
336 aa  229  5e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.205192 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1128  ABC transporter related  33.54 
 
 
328 aa  229  6e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0395401  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2350  ABC transporter related  36.99 
 
 
324 aa  228  9e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1966  ABC transporter related  41.74 
 
 
324 aa  228  9e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000391335  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0404  ABC transporter, ATPase subunit  39.16 
 
 
334 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1759  ABC transporter-like protein protein  38.31 
 
 
326 aa  227  3e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.984007  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1396  ABC transporter related protein  38.63 
 
 
331 aa  226  6e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0433  ABC transporter related  38.86 
 
 
334 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0432  ABC transporter-related protein  38.55 
 
 
334 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2818  ABC transporter related protein  38.32 
 
 
333 aa  223  4e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.700865  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09011  putative multidrug efflux ABC transporter  36.76 
 
 
332 aa  222  6e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266178 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2410  ABC transporter related  38.59 
 
 
332 aa  222  6e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2497  ABC transporter related  38.44 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.946851  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0234  ATPase  36.76 
 
 
332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.822297  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0536  ABC transporter related protein  39.82 
 
 
328 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0550  ABC transporter-like protein  39.82 
 
 
328 aa  218  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0547  ABC transporter related  43.92 
 
 
333 aa  216  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0178  ATPase  39.67 
 
 
325 aa  211  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.604425  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  33.44 
 
 
331 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3395  ABC transporter, ATP-binding protein  34.27 
 
 
338 aa  206  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109056  hitchhiker  0.000000258754 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  31.6 
 
 
329 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4166  ABC transporter related  39.09 
 
 
332 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675613  normal  0.359967 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  31.87 
 
 
331 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0981  ATPase  32.19 
 
 
331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425969  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3566  ABC transporter related  39.18 
 
 
302 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0893  ABC transporter, ATP-binding protein  28.66 
 
 
343 aa  187  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1507  ABC transporter related protein  31.64 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  decreased coverage  0.000000000014489  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0136  ABC transporter related protein  34.75 
 
 
314 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2951  ABC transporter related  34.68 
 
 
260 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2651  ABC transporter, ATP-binding protein  32.2 
 
 
329 aa  156  6e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1136  ABC transporter related  33.33 
 
 
334 aa  155  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.96 
 
 
327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.57 
 
 
305 aa  153  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.22 
 
 
328 aa  152  8e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  29.63 
 
 
327 aa  151  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0785  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.83 
 
 
324 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3319  ABC transporter related  33.33 
 
 
332 aa  150  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  33.95 
 
 
241 aa  149  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.76 
 
 
327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  33 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>