More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1966 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1966  ABC transporter related  100 
 
 
324 aa  669    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000391335  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2319  ABC transporter related protein  85 
 
 
323 aa  552  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2515  ABC transporter related  53.75 
 
 
324 aa  361  9e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0404  ABC transporter, ATPase subunit  53.4 
 
 
334 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0432  ABC transporter-related protein  51.98 
 
 
334 aa  351  8.999999999999999e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0433  ABC transporter related  51.98 
 
 
334 aa  350  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2497  ABC transporter related  50.61 
 
 
328 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.946851  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29121  putative multidrug efflux ABC transporter  49.85 
 
 
331 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1284  ABC transporter related  48.61 
 
 
329 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.980121 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2682  ABC transporter-like  49.23 
 
 
326 aa  332  6e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.241225  normal  0.53563 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0178  ATPase  49.69 
 
 
325 aa  331  9e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.604425  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3407  ABC transporter related  48.04 
 
 
336 aa  331  9e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.205192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2031  ABC transporter related  48.6 
 
 
329 aa  329  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2891  ABC transporter-like protein  49.38 
 
 
330 aa  327  1.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2818  ABC transporter related protein  49.85 
 
 
333 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.700865  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4166  ABC transporter related  53.87 
 
 
332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675613  normal  0.359967 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2057  ABC transporter related  48.29 
 
 
329 aa  325  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2557  ATPase  49.54 
 
 
324 aa  324  1e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0234  ATPase  48.14 
 
 
332 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.822297  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09011  putative multidrug efflux ABC transporter  48.14 
 
 
332 aa  322  4e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0660  ABC transporter related  49.06 
 
 
337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  hitchhiker  0.000000264016 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2211  ATPase  49.23 
 
 
328 aa  317  2e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1759  ABC transporter-like protein protein  46.13 
 
 
326 aa  315  9e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.984007  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2350  ABC transporter related  46.75 
 
 
324 aa  310  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1396  ABC transporter related protein  45.68 
 
 
331 aa  309  5e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2410  ABC transporter related  47.13 
 
 
332 aa  305  5.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1441  ABC transporter related protein  50.62 
 
 
326 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1358  ABC transporter related protein  45.87 
 
 
334 aa  294  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  42.81 
 
 
331 aa  289  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0486  ABC transporter related  42.51 
 
 
334 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3395  ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 
338 aa  287  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109056  hitchhiker  0.000000258754 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  42.19 
 
 
331 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0981  ATPase  42.5 
 
 
331 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425969  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  42.59 
 
 
329 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0454  ABC transporter-related protein  42.31 
 
 
337 aa  281  9e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0448  ABC transporter related  42.69 
 
 
337 aa  280  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0537  ABC transporter, ATP-binding protein  42.69 
 
 
337 aa  281  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0588  ABC transporter, ATP-binding protein  42.39 
 
 
337 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4789  ABC transporter, ATP-binding protein  42.69 
 
 
337 aa  280  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0670413  hitchhiker  0.00137355 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0587  ABC transporter, ATP-binding protein  42.09 
 
 
337 aa  278  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0500  ABC transporter ATP-binding protein  42.09 
 
 
337 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0443  ABC transporter, ATP-binding protein  42.09 
 
 
337 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0439  ABC transporter, ATP-binding protein  42.09 
 
 
337 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0532  ABC transporter ATP-binding protein  42.09 
 
 
337 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0515  ABC transporter, ATP-binding protein  42.09 
 
 
337 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00155864 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0911  ABC transporter related protein  40.5 
 
 
329 aa  275  5e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2673  ABC transporter related  41.05 
 
 
324 aa  268  8e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0190306  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2522  ABC transporter related  41.21 
 
 
336 aa  268  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0978  ABC transporter related  40 
 
 
342 aa  265  8e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1189  ABC transporter related protein  40.99 
 
 
322 aa  265  8e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1832  ABC transporter related  43.21 
 
 
335 aa  264  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0526  ABC transporter related protein  40.68 
 
 
328 aa  262  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2073  ABC transporter-related protein  48.19 
 
 
276 aa  256  5e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111987  normal  0.868445 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3780  ABC transporter related  49.37 
 
 
265 aa  255  7e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000137492  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3863  ABC transporter related  40.68 
 
 
329 aa  255  8e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1069  ABC transporter related  47.6 
 
 
285 aa  255  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0434  ABC transporter related  37.58 
 
 
336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0659  ABC transporter, ATP-binding protein  40.61 
 
 
330 aa  249  5e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0444  ABC transporter related  40.72 
 
 
324 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2220  ABC transporter related  39.26 
 
 
333 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.580066  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0172  ABC transporter, ATP-binding protein  37.06 
 
 
341 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4689  ABC transporter related  40.67 
 
 
331 aa  245  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0175  ABC transporter, ATP-binding protein  36.76 
 
 
341 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2519  ABC transporter related  38.96 
 
 
333 aa  242  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.791521  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1920  ABC transporter related  41.74 
 
 
324 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567782  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2493  ABC transporter related protein  47.4 
 
 
318 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000144687  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5809  ABC transporter related  45.6 
 
 
292 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0487  ABC transporter, ATP-binding protein  46.03 
 
 
261 aa  235  6e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.139587  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4781  ABC transporter related protein  42.61 
 
 
330 aa  235  7e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.975884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0547  ABC transporter related  42.17 
 
 
333 aa  232  6e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2385  ABC transporter related  39.24 
 
 
320 aa  230  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6487  ABC transporter related  40.06 
 
 
317 aa  229  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0112869  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0893  ABC transporter, ATP-binding protein  44.68 
 
 
343 aa  229  5e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3436  ABC transporter, ATP-binding protein  44.79 
 
 
254 aa  229  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.352902 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1128  ABC transporter related  35.51 
 
 
328 aa  226  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0395401  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3919  ABC transporter related protein  40.8 
 
 
318 aa  226  5.0000000000000005e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0536  ABC transporter related protein  37.23 
 
 
328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0550  ABC transporter-like protein  37.23 
 
 
328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4151  ABC transporter related protein  35.29 
 
 
321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0325933 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3153  ABC transporter related  37.65 
 
 
323 aa  212  4.9999999999999996e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148075  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0425  ABC transporter related protein  42.26 
 
 
339 aa  209  5e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12840  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.15 
 
 
341 aa  205  7e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08570  ABC transporter related  39.22 
 
 
262 aa  199  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09750  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  38.25 
 
 
342 aa  199  7.999999999999999e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2651  ABC transporter, ATP-binding protein  38.2 
 
 
329 aa  191  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4137  ABC transporter related  39.57 
 
 
326 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1507  ABC transporter related protein  38.98 
 
 
314 aa  188  1e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  decreased coverage  0.000000000014489  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3566  ABC transporter related  38.28 
 
 
302 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0136  ABC transporter related protein  33.45 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.12 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.55 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.55 
 
 
323 aa  162  7e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.23 
 
 
324 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.23 
 
 
324 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  37.45 
 
 
266 aa  161  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.35 
 
 
317 aa  160  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0785  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.86 
 
 
324 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.65 
 
 
316 aa  160  3e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.23 
 
 
329 aa  159  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  40.83 
 
 
339 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>