More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1069 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1069  ABC transporter related  100 
 
 		 285 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5809  ABC transporter related  82.94 
 
 		 292 aa  468  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2073  ABC transporter-related protein  83.16 
 
 		 276 aa  462  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111987  normal  0.868445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4689  ABC transporter related  74.62 
 
 		 331 aa  458  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3780  ABC transporter related  59.09 
 
 		 265 aa  297  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000137492  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2673  ABC transporter related  55.06 
 
 		 324 aa  292  5e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0190306  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2522  ABC transporter related  49.81 
 
 		 336 aa  289  4e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0444  ABC transporter related  51.99 
 
 		 324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0487  ABC transporter, ATP-binding protein  52.92 
 
 		 261 aa  270  2e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.139587  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1832  ABC transporter related  52.3 
 
 		 335 aa  266  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1358  ABC transporter related protein  50.79 
 
 		 334 aa  265  5e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0172  ABC transporter, ATP-binding protein  48.36 
 
 		 341 aa  263  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0175  ABC transporter, ATP-binding protein  48.36 
 
 		 341 aa  263  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0978  ABC transporter related  46.91 
 
 		 342 aa  261  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0486  ABC transporter related  49.39 
 
 		 334 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0537  ABC transporter, ATP-binding protein  49.4 
 
 		 337 aa  256  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0448  ABC transporter related  49.4 
 
 		 337 aa  256  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1189  ABC transporter related protein  50 
 
 		 322 aa  255  6e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4789  ABC transporter, ATP-binding protein  49.4 
 
 		 337 aa  254  8e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0670413  hitchhiker  0.00137355 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0587  ABC transporter, ATP-binding protein  49.4 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0515  ABC transporter, ATP-binding protein  49.4 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00155864 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0500  ABC transporter ATP-binding protein  49.4 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0443  ABC transporter, ATP-binding protein  49.4 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0439  ABC transporter, ATP-binding protein  49.4 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0454  ABC transporter-related protein  49.4 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0532  ABC transporter ATP-binding protein  49.4 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0588  ABC transporter, ATP-binding protein  49.4 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0526  ABC transporter related protein  48.34 
 
 		 328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0660  ABC transporter related  51.72 
 
 		 337 aa  253  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  hitchhiker  0.000000264016 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2385  ABC transporter related  54.55 
 
 		 320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3436  ABC transporter, ATP-binding protein  53.41 
 
 		 254 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.352902 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2515  ABC transporter related  49.59 
 
 		 324 aa  249  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2220  ABC transporter related  51.64 
 
 		 333 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.580066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2519  ABC transporter related  51.23 
 
 		 333 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.791521  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0434  ABC transporter related  48.99 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0659  ABC transporter, ATP-binding protein  47.97 
 
 		 330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2493  ABC transporter related protein  58.45 
 
 		 318 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000144687  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2319  ABC transporter related protein  49.6 
 
 		 323 aa  238  9e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2818  ABC transporter related protein  46.72 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.700865  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1920  ABC transporter related  52.63 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2891  ABC transporter-like protein  47.95 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1966  ABC transporter related  47.6 
 
 		 324 aa  235  6e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000391335  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2057  ABC transporter related  40.99 
 
 		 329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2031  ABC transporter related  40.99 
 
 		 329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2682  ABC transporter-like  47.13 
 
 		 326 aa  232  6e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.241225  normal  0.53563 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3407  ABC transporter related  44.67 
 
 		 336 aa  229  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2497  ABC transporter related  43.89 
 
 		 328 aa  228  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.946851  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0404  ABC transporter, ATPase subunit  47.41 
 
 		 334 aa  228  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1128  ABC transporter related  41.18 
 
 		 328 aa  228  8e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0395401  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0432  ABC transporter-related protein  47.01 
 
 		 334 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1396  ABC transporter related protein  44.12 
 
 		 331 aa  226  3e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0433  ABC transporter related  47.41 
 
 		 334 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4781  ABC transporter related protein  51.69 
 
 		 330 aa  226  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.975884 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1441  ABC transporter related protein  51.04 
 
 		 326 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0536  ABC transporter related protein  47.95 
 
 		 328 aa  224  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0550  ABC transporter-like protein  47.95 
 
 		 328 aa  224  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2410  ABC transporter related  43.97 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4166  ABC transporter related  50.2 
 
 		 332 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675613  normal  0.359967 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1759  ABC transporter-like protein protein  42.91 
 
 		 326 aa  223  4e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.984007  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0178  ATPase  44.87 
 
 		 325 aa  222  6e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.604425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1284  ABC transporter related  42.91 
 
 		 329 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.980121 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0425  ABC transporter related protein  43.62 
 
 		 339 aa  222  7e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6487  ABC transporter related  58.64 
 
 		 317 aa  221  9e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0112869  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4151  ABC transporter related protein  51.8 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0325933 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2350  ABC transporter related  44.54 
 
 		 324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0547  ABC transporter related  48.83 
 
 		 333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3863  ABC transporter related  42.23 
 
 		 329 aa  218  7.999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2557  ATPase  47.39 
 
 		 324 aa  216  4e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3395  ABC transporter, ATP-binding protein  42.55 
 
 		 338 aa  215  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109056  hitchhiker  0.000000258754 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  42.17 
 
 		 331 aa  215  9e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29121  putative multidrug efflux ABC transporter  45.23 
 
 		 331 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3919  ABC transporter related protein  54.63 
 
 		 318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09750  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  54.25 
 
 		 342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  39.91 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  41.28 
 
 		 329 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3153  ABC transporter related  50.88 
 
 		 323 aa  209  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2211  ATPase  47.3 
 
 		 328 aa  209  5e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0911  ABC transporter related protein  37.27 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0981  ATPase  40.34 
 
 		 331 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425969  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0234  ATPase  40.46 
 
 		 332 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.822297  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12840  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  48.21 
 
 		 341 aa  203  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09011  putative multidrug efflux ABC transporter  40.46 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266178 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2651  ABC transporter, ATP-binding protein  38.56 
 
 		 329 aa  199  5e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0893  ABC transporter, ATP-binding protein  36.02 
 
 		 343 aa  197  1.0000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4137  ABC transporter related  56.07 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08570  ABC transporter related  50.6 
 
 		 262 aa  188  8e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3566  ABC transporter related  43.97 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1507  ABC transporter related protein  37.13 
 
 		 314 aa  179  4e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  decreased coverage  0.000000000014489  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0136  ABC transporter related protein  39.62 
 
 		 314 aa  176  5e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.01 
 
 		 317 aa  154  1e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.52 
 
 		 316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  36.12 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  43.66 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.99 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.62 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  43.66 
 
 		 316 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.26 
 
 		 317 aa  149  4e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.86 
 
 		 334 aa  148  9e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  39.07 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  40.81 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>