32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3303 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3303  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  635    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2496  hypothetical protein  56.72 
 
 		 306 aa  288  8e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510371  normal  0.78909 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2099  hypothetical protein  60.99 
 
 		 309 aa  268  5.9999999999999995e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1615  hypothetical protein  58.74 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.507847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1149  hypothetical protein  45.76 
 
 		 282 aa  222  8e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4003  hypothetical protein  50.93 
 
 		 292 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2307  hypothetical protein  45.85 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.316541  hitchhiker  0.00344401 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1012  hypothetical protein  51.78 
 
 		 286 aa  192  7e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.751055  normal  0.658144 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3146  hypothetical protein  38.6 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.386138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4593  hypothetical protein  33.22 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3508  hypothetical protein  31.39 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0353  hypothetical protein  28.71 
 
 		 298 aa  122  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0347  hypothetical protein  28.95 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000040068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3885  hypothetical protein  30.9 
 
 		 287 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.442577  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3673  hypothetical protein  29.1 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000179786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0328  hypothetical protein  29.21 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161313 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4365  hypothetical protein  28.52 
 
 		 297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3376  hypothetical protein  33.67 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0449  hypothetical protein  32.5 
 
 		 299 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204178  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0343  hypothetical protein  29.01 
 
 		 297 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0345  hypothetical protein  29.56 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0499672  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0353  hypothetical protein  29.56 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000314357 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0350  hypothetical protein  29.56 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.730516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3477  hypothetical protein  24.92 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.317909  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0355  hypothetical protein  24.83 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0454  hypothetical protein  31.36 
 
 		 263 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.453898  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04039  putative orphan protein  32.14 
 
 		 281 aa  94  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4275  hypothetical protein  34.48 
 
 		 279 aa  92.4  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3761  hypothetical protein  25.25 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0483  hypothetical protein  34.29 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0488  hypothetical protein  34.86 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3612  hypothetical protein  30 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248818  normal  0.0127262 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>