32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2099 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2099  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  598  1e-170  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1615  hypothetical protein  97.09 
 
 
308 aa  498  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.507847  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2496  hypothetical protein  61.84 
 
 
306 aa  322  5e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510371  normal  0.78909 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3303  hypothetical protein  54 
 
 
315 aa  284  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2307  hypothetical protein  53.23 
 
 
326 aa  260  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.316541  hitchhiker  0.00344401 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1149  hypothetical protein  44.8 
 
 
282 aa  211  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4003  hypothetical protein  48.85 
 
 
292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1012  hypothetical protein  55.78 
 
 
286 aa  186  5e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.751055  normal  0.658144 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3673  hypothetical protein  30 
 
 
298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000179786  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0353  hypothetical protein  30 
 
 
298 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0347  hypothetical protein  29.03 
 
 
298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000040068  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4593  hypothetical protein  30.36 
 
 
289 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0343  hypothetical protein  29.58 
 
 
297 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3146  hypothetical protein  40.74 
 
 
273 aa  125  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.386138  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3508  hypothetical protein  30.74 
 
 
290 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4365  hypothetical protein  29.45 
 
 
297 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0350  hypothetical protein  29.49 
 
 
298 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.730516  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0353  hypothetical protein  29.49 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000314357 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0345  hypothetical protein  29.49 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0499672  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0449  hypothetical protein  27.48 
 
 
299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204178  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3885  hypothetical protein  30.48 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.442577  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0355  hypothetical protein  27.56 
 
 
295 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0328  hypothetical protein  27.54 
 
 
289 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0161313 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3376  hypothetical protein  29.15 
 
 
295 aa  106  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3477  hypothetical protein  26.9 
 
 
308 aa  96.7  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.317909  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04039  putative orphan protein  32.64 
 
 
281 aa  90.5  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3761  hypothetical protein  26.74 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0454  hypothetical protein  31.8 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.453898  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4275  hypothetical protein  34.16 
 
 
279 aa  77  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0483  hypothetical protein  32.16 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0488  hypothetical protein  30.77 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3612  hypothetical protein  32.54 
 
 
269 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248818  normal  0.0127262 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>