32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0483 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0483  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  511  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0454  hypothetical protein  86.64 
 
 
263 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.453898  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0488  hypothetical protein  95.08 
 
 
264 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3612  hypothetical protein  55.03 
 
 
269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248818  normal  0.0127262 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4593  hypothetical protein  27.74 
 
 
289 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3508  hypothetical protein  32.52 
 
 
290 aa  106  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0449  hypothetical protein  31.71 
 
 
299 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204178  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4365  hypothetical protein  32.34 
 
 
297 aa  102  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0343  hypothetical protein  31.71 
 
 
297 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0355  hypothetical protein  27.5 
 
 
295 aa  102  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0328  hypothetical protein  34.76 
 
 
289 aa  102  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0161313 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0353  hypothetical protein  31.71 
 
 
298 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000314357 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0345  hypothetical protein  31.71 
 
 
298 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0499672  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0350  hypothetical protein  31.1 
 
 
298 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.730516  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0347  hypothetical protein  31.74 
 
 
298 aa  99.8  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000040068  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04039  putative orphan protein  32.45 
 
 
281 aa  99.8  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3885  hypothetical protein  31.71 
 
 
287 aa  99.8  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.442577  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0353  hypothetical protein  31.74 
 
 
298 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3673  hypothetical protein  31.74 
 
 
298 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000179786  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3477  hypothetical protein  30.63 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.317909  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3376  hypothetical protein  27.24 
 
 
295 aa  90.1  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3303  hypothetical protein  34.29 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4275  hypothetical protein  30.11 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2099  hypothetical protein  32.16 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3761  hypothetical protein  28.09 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2496  hypothetical protein  29.92 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510371  normal  0.78909 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1615  hypothetical protein  31.58 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.507847  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2307  hypothetical protein  28.72 
 
 
326 aa  68.9  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.316541  hitchhiker  0.00344401 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1149  hypothetical protein  29.71 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4003  hypothetical protein  26.46 
 
 
292 aa  63.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1012  hypothetical protein  36.64 
 
 
286 aa  61.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.751055  normal  0.658144 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3146  hypothetical protein  32.81 
 
 
273 aa  53.1  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.386138  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>