32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3146 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3146  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  538  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.386138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3303  hypothetical protein  38.6 
 
 		 315 aa  138  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1149  hypothetical protein  40.09 
 
 		 282 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1012  hypothetical protein  39.46 
 
 		 286 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.751055  normal  0.658144 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4003  hypothetical protein  38.46 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2099  hypothetical protein  40.09 
 
 		 309 aa  123  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1615  hypothetical protein  39.17 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.507847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2307  hypothetical protein  38.21 
 
 		 326 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.316541  hitchhiker  0.00344401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2496  hypothetical protein  36.44 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510371  normal  0.78909 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04039  putative orphan protein  31.71 
 
 		 281 aa  87.4  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3885  hypothetical protein  27.12 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.442577  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3508  hypothetical protein  27.07 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4593  hypothetical protein  26.01 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0343  hypothetical protein  25.53 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0353  hypothetical protein  25.86 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3673  hypothetical protein  25.26 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000179786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0350  hypothetical protein  26.7 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.730516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0353  hypothetical protein  26.7 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000314357 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4275  hypothetical protein  31.75 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0345  hypothetical protein  26.7 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0499672  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0328  hypothetical protein  28.06 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161313 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4365  hypothetical protein  25.84 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0449  hypothetical protein  25.37 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204178  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0347  hypothetical protein  24.4 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000040068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0454  hypothetical protein  30.67 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.453898  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3477  hypothetical protein  25 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.317909  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3376  hypothetical protein  26 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0355  hypothetical protein  21.74 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3761  hypothetical protein  25 
 
 		 328 aa  49.7  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3612  hypothetical protein  28.57 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248818  normal  0.0127262 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0488  hypothetical protein  34.38 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0483  hypothetical protein  32.81 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>