32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0355 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0355  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  593  1e-168  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3477  hypothetical protein  64.19 
 
 		 308 aa  386  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.317909  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4593  hypothetical protein  52.2 
 
 		 289 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0343  hypothetical protein  53.02 
 
 		 297 aa  310  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3885  hypothetical protein  52.05 
 
 		 287 aa  310  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.442577  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0350  hypothetical protein  53.51 
 
 		 298 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.730516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0328  hypothetical protein  51.19 
 
 		 289 aa  306  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161313 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0353  hypothetical protein  53.18 
 
 		 298 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000314357 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0345  hypothetical protein  53.18 
 
 		 298 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0499672  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0353  hypothetical protein  52.65 
 
 		 298 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3673  hypothetical protein  51.8 
 
 		 298 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000179786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3508  hypothetical protein  51.7 
 
 		 290 aa  299  4e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0347  hypothetical protein  51.51 
 
 		 298 aa  296  4e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000040068  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4365  hypothetical protein  50 
 
 		 297 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0449  hypothetical protein  50 
 
 		 299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204178  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3376  hypothetical protein  47.68 
 
 		 295 aa  258  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3761  hypothetical protein  31.49 
 
 		 328 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0454  hypothetical protein  26.79 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.453898  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04039  putative orphan protein  30.29 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4275  hypothetical protein  30.69 
 
 		 279 aa  99.8  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2099  hypothetical protein  29.05 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1615  hypothetical protein  29.19 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.507847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0488  hypothetical protein  31.71 
 
 		 264 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3612  hypothetical protein  29.7 
 
 		 269 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248818  normal  0.0127262 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3303  hypothetical protein  27.27 
 
 		 315 aa  89.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0483  hypothetical protein  30.49 
 
 		 264 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1149  hypothetical protein  26.83 
 
 		 282 aa  89.4  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2496  hypothetical protein  28.02 
 
 		 306 aa  87  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510371  normal  0.78909 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2307  hypothetical protein  24.02 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.316541  hitchhiker  0.00344401 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4003  hypothetical protein  25.15 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1012  hypothetical protein  25.7 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.751055  normal  0.658144 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3146  hypothetical protein  24 
 
 		 273 aa  52.8  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.386138  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>