32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3508 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3508  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  578  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4593  hypothetical protein  68.86 
 
 		 289 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0328  hypothetical protein  65.62 
 
 		 289 aa  371  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161313 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3885  hypothetical protein  62.72 
 
 		 287 aa  363  1e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.442577  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0355  hypothetical protein  54.42 
 
 		 295 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3673  hypothetical protein  51.67 
 
 		 298 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000179786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0353  hypothetical protein  51.67 
 
 		 298 aa  306  3e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3477  hypothetical protein  51.48 
 
 		 308 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.317909  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0343  hypothetical protein  51.01 
 
 		 297 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0347  hypothetical protein  51 
 
 		 298 aa  300  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000040068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0350  hypothetical protein  49.66 
 
 		 298 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.730516  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4365  hypothetical protein  50 
 
 		 297 aa  295  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0345  hypothetical protein  49.66 
 
 		 298 aa  295  5e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0499672  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0353  hypothetical protein  49.66 
 
 		 298 aa  295  5e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000314357 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0449  hypothetical protein  48.49 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204178  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3376  hypothetical protein  52.2 
 
 		 295 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3761  hypothetical protein  33.09 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04039  putative orphan protein  35.91 
 
 		 281 aa  126  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2099  hypothetical protein  31.84 
 
 		 309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1149  hypothetical protein  29.29 
 
 		 282 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3303  hypothetical protein  32.67 
 
 		 315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1615  hypothetical protein  31.08 
 
 		 308 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.507847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4275  hypothetical protein  37.3 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0454  hypothetical protein  32 
 
 		 263 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.453898  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2496  hypothetical protein  28.62 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510371  normal  0.78909 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0488  hypothetical protein  33.74 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4003  hypothetical protein  32.74 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2307  hypothetical protein  28.74 
 
 		 326 aa  99.8  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.316541  hitchhiker  0.00344401 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0483  hypothetical protein  32.14 
 
 		 264 aa  99.4  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3612  hypothetical protein  29.88 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248818  normal  0.0127262 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1012  hypothetical protein  26.87 
 
 		 286 aa  89  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.751055  normal  0.658144 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3146  hypothetical protein  28.99 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.386138  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>