32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4365 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4365  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  598  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0353  hypothetical protein  90.6 
 
 		 298 aa  550  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3673  hypothetical protein  90.27 
 
 		 298 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000179786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0347  hypothetical protein  88.26 
 
 		 298 aa  517  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000040068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0343  hypothetical protein  80.73 
 
 		 297 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0353  hypothetical protein  77.27 
 
 		 298 aa  461  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000314357 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0345  hypothetical protein  77.27 
 
 		 298 aa  461  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0499672  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0350  hypothetical protein  76.62 
 
 		 298 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.730516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0449  hypothetical protein  76.25 
 
 		 299 aa  437  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204178  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0328  hypothetical protein  56.19 
 
 		 289 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161313 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4593  hypothetical protein  56.04 
 
 		 289 aa  323  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3885  hypothetical protein  53.36 
 
 		 287 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.442577  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0355  hypothetical protein  51.68 
 
 		 295 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3477  hypothetical protein  50.98 
 
 		 308 aa  299  5e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.317909  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3508  hypothetical protein  47.6 
 
 		 290 aa  293  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3376  hypothetical protein  50.33 
 
 		 295 aa  268  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3761  hypothetical protein  30.14 
 
 		 328 aa  122  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2496  hypothetical protein  31.16 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510371  normal  0.78909 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4275  hypothetical protein  37.1 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2099  hypothetical protein  33.49 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1615  hypothetical protein  33.49 
 
 		 308 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.507847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3303  hypothetical protein  32.21 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04039  putative orphan protein  31.76 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2307  hypothetical protein  30.8 
 
 		 326 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.316541  hitchhiker  0.00344401 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1149  hypothetical protein  27.72 
 
 		 282 aa  105  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0454  hypothetical protein  33.53 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.453898  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0488  hypothetical protein  32.93 
 
 		 264 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3612  hypothetical protein  32.53 
 
 		 269 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248818  normal  0.0127262 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0483  hypothetical protein  32.34 
 
 		 264 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4003  hypothetical protein  29.72 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1012  hypothetical protein  28 
 
 		 286 aa  79  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.751055  normal  0.658144 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3146  hypothetical protein  26.15 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.386138  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>