32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4593 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4593  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0328  hypothetical protein  76.12 
 
 		 289 aa  432  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161313 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3885  hypothetical protein  68.75 
 
 		 287 aa  381  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.442577  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3508  hypothetical protein  68.17 
 
 		 290 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0343  hypothetical protein  55.67 
 
 		 297 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3477  hypothetical protein  52.92 
 
 		 308 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.317909  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0353  hypothetical protein  54.33 
 
 		 298 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0355  hypothetical protein  52.2 
 
 		 295 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3673  hypothetical protein  54.85 
 
 		 298 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000179786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0350  hypothetical protein  53.82 
 
 		 298 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.730516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0353  hypothetical protein  53.82 
 
 		 298 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000314357 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0345  hypothetical protein  53.82 
 
 		 298 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0499672  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0347  hypothetical protein  52.44 
 
 		 298 aa  309  4e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000040068  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4365  hypothetical protein  52.46 
 
 		 297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0449  hypothetical protein  52.35 
 
 		 299 aa  296  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204178  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3376  hypothetical protein  50.32 
 
 		 295 aa  281  9e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3761  hypothetical protein  32.51 
 
 		 328 aa  136  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1149  hypothetical protein  30.36 
 
 		 282 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04039  putative orphan protein  33.46 
 
 		 281 aa  119  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2099  hypothetical protein  32.7 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3303  hypothetical protein  33.82 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4275  hypothetical protein  37.57 
 
 		 279 aa  116  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1615  hypothetical protein  32.7 
 
 		 308 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.507847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0454  hypothetical protein  33.49 
 
 		 263 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.453898  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2496  hypothetical protein  29.63 
 
 		 306 aa  99.8  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510371  normal  0.78909 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0488  hypothetical protein  34.76 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2307  hypothetical protein  29.33 
 
 		 326 aa  96.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.316541  hitchhiker  0.00344401 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3612  hypothetical protein  31.52 
 
 		 269 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248818  normal  0.0127262 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0483  hypothetical protein  33.14 
 
 		 264 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4003  hypothetical protein  33.14 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1012  hypothetical protein  29.07 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.751055  normal  0.658144 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3146  hypothetical protein  27.18 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.386138  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>