32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0347 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0347  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000040068  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0353  hypothetical protein  95.97 
 
 
298 aa  580  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3673  hypothetical protein  95.3 
 
 
298 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000179786  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4365  hypothetical protein  88.93 
 
 
297 aa  503  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0343  hypothetical protein  80.4 
 
 
297 aa  477  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0353  hypothetical protein  78.74 
 
 
298 aa  461  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000314357 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0345  hypothetical protein  78.74 
 
 
298 aa  461  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0499672  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0350  hypothetical protein  78.07 
 
 
298 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.730516  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0449  hypothetical protein  76.92 
 
 
299 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204178  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4593  hypothetical protein  54.33 
 
 
289 aa  318  5e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0328  hypothetical protein  55.45 
 
 
289 aa  317  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0161313 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3885  hypothetical protein  51.99 
 
 
287 aa  309  4e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.442577  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0355  hypothetical protein  51.51 
 
 
295 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3477  hypothetical protein  50.98 
 
 
308 aa  299  4e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.317909  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3508  hypothetical protein  50.67 
 
 
290 aa  290  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3376  hypothetical protein  51.83 
 
 
295 aa  266  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3761  hypothetical protein  30.21 
 
 
328 aa  119  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4275  hypothetical protein  36.56 
 
 
279 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3303  hypothetical protein  32.54 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2099  hypothetical protein  32.06 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2496  hypothetical protein  31.77 
 
 
306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510371  normal  0.78909 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1615  hypothetical protein  32.54 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.507847  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2307  hypothetical protein  31.88 
 
 
326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.316541  hitchhiker  0.00344401 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04039  putative orphan protein  32.43 
 
 
281 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1149  hypothetical protein  31.13 
 
 
282 aa  106  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0454  hypothetical protein  30.18 
 
 
263 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.453898  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3612  hypothetical protein  33.73 
 
 
269 aa  99  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248818  normal  0.0127262 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0488  hypothetical protein  33.13 
 
 
264 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4003  hypothetical protein  30.73 
 
 
292 aa  93.2  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0483  hypothetical protein  31.74 
 
 
264 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1012  hypothetical protein  29 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.751055  normal  0.658144 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3146  hypothetical protein  25 
 
 
273 aa  63.2  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.386138  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>