44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0492 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0359  putative site-specific recombinase transmembrane protein  62.5 
 
 		 660 aa  746    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3662  putative site-specific recombinase transmembrane protein  61.31 
 
 		 654 aa  777    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0492  putative site-specific recombinase transmembrane protein  100 
 
 		 656 aa  1282    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0436  putative site-specific recombinase transmembrane protein  61.76 
 
 		 663 aa  750    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27543 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0720  putative site-specific recombinase transmembrane protein  58.54 
 
 		 655 aa  701    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0348  putative site-specific recombinase transmembrane protein  62.96 
 
 		 660 aa  750    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0876893  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0530  putative site-specific recombinase transmembrane protein  61.98 
 
 		 684 aa  728    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4468  putative site-specific recombinase transmembrane protein  60.61 
 
 		 657 aa  734    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3901  putative site-specific recombinase transmembrane protein  47.55 
 
 		 694 aa  533  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0800854 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3469  putative site-specific recombinase transmembrane protein  48.88 
 
 		 700 aa  509  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1056  putative site-specific recombinase transmembrane protein  39.76 
 
 		 705 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0715578  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0942  putative site-specific recombinase transmembrane protein  39.82 
 
 		 694 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.145069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0877  putative site-specific recombinase transmembrane protein  39.52 
 
 		 694 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.104417 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3386  hypothetical protein  37.78 
 
 		 705 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2558  putative membrane proten  37.78 
 
 		 705 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3377  putative membrane proten  37.78 
 
 		 705 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3343  site-specific recombinase  37.78 
 
 		 705 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1151  putative membrane proten  37.78 
 
 		 705 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1012  putative site-specific recombinase transmembrane protein  40.72 
 
 		 696 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.644984 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0289  putative membrane proten  37.78 
 
 		 705 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4002  putative site-specific recombinase transmembrane protein  37.82 
 
 		 722 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1023  putative site-specific recombinase transmembrane protein  39.57 
 
 		 703 aa  398  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.926056  normal  0.592134 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1266  hypothetical protein  37.71 
 
 		 704 aa  391  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942074  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2375  membrane proten, putative  39.23 
 
 		 624 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.552217  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0599  site-specific recombinase-like protein  37.92 
 
 		 707 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264915  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0709  site-specific recombinase-like protein  37.23 
 
 		 704 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0225  site-specific recombinase-like  37.23 
 
 		 704 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277689  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0676  site-specific recombinase-like protein  37.2 
 
 		 704 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3796  site-specific recombinase-like  37.92 
 
 		 707 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2676  site-specific recombinase-like protein  38.53 
 
 		 728 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0624  site-specific recombinase-like protein  37.94 
 
 		 707 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.232961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2054  putative site-specific recombinase transmembrane protein  32.23 
 
 		 706 aa  290  6e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0607  site-specific recombinase  33.23 
 
 		 669 aa  259  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248138  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1665  site-specific recombinase Gcr  31.76 
 
 		 673 aa  236  7e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.977345 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1614  site-specific recombinase  31.24 
 
 		 698 aa  229  9e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0576  putative site-specific recombinase, prophage insertion  28.74 
 
 		 682 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000232694  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0363  putative site-specific recombinase  30.05 
 
 		 672 aa  211  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.731088  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1454  putative site-specific recombinase  24.89 
 
 		 826 aa  211  4e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0463  site-specific recombinase  30.06 
 
 		 686 aa  211  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0963  site-specific recombinase  24.89 
 
 		 826 aa  208  2e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.482047  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0910  site-specific recombinase-like protein  25.51 
 
 		 810 aa  206  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0375775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1604  hypothetical protein  27.23 
 
 		 679 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0288386  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1488  putative site-specific recombinase  25.46 
 
 		 676 aa  183  1e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6101  site-specific recombinase  27.46 
 
 		 652 aa  120  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.542674  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>