44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1488 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1488  putative site-specific recombinase  100 
 
 		 676 aa  1400    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1454  putative site-specific recombinase  32.34 
 
 		 826 aa  344  4e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0910  site-specific recombinase-like protein  32.44 
 
 		 810 aa  339  9.999999999999999e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0375775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0963  site-specific recombinase  31.6 
 
 		 826 aa  335  1e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.482047  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0463  site-specific recombinase  28.14 
 
 		 686 aa  321  3e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0576  putative site-specific recombinase, prophage insertion  30.52 
 
 		 682 aa  320  6e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000232694  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1614  site-specific recombinase  29.47 
 
 		 698 aa  294  3e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0363  putative site-specific recombinase  29.7 
 
 		 672 aa  291  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.731088  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1665  site-specific recombinase Gcr  28.06 
 
 		 673 aa  277  5e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.977345 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1604  hypothetical protein  29.17 
 
 		 679 aa  276  9e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0288386  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0607  site-specific recombinase  28.15 
 
 		 669 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248138  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6101  site-specific recombinase  26.38 
 
 		 652 aa  236  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.542674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4002  putative site-specific recombinase transmembrane protein  25.99 
 
 		 722 aa  198  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3901  putative site-specific recombinase transmembrane protein  26.56 
 
 		 694 aa  195  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0800854 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2558  putative membrane proten  25.49 
 
 		 705 aa  195  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3343  site-specific recombinase  25.49 
 
 		 705 aa  195  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0289  putative membrane proten  25.49 
 
 		 705 aa  195  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1151  putative membrane proten  25.49 
 
 		 705 aa  195  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2375  membrane proten, putative  25.49 
 
 		 624 aa  195  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.552217  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3386  hypothetical protein  25.32 
 
 		 705 aa  193  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3377  putative membrane proten  25.32 
 
 		 705 aa  193  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1266  hypothetical protein  25.65 
 
 		 704 aa  193  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942074  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1056  putative site-specific recombinase transmembrane protein  24.77 
 
 		 705 aa  188  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0715578  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0942  putative site-specific recombinase transmembrane protein  24.71 
 
 		 694 aa  188  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.145069 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0599  site-specific recombinase-like protein  25.89 
 
 		 707 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264915  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0676  site-specific recombinase-like protein  26.21 
 
 		 704 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0225  site-specific recombinase-like  26.05 
 
 		 704 aa  184  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277689  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0709  site-specific recombinase-like protein  26.05 
 
 		 704 aa  184  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0877  putative site-specific recombinase transmembrane protein  24.8 
 
 		 694 aa  179  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.104417 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3469  putative site-specific recombinase transmembrane protein  26.51 
 
 		 700 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0530  putative site-specific recombinase transmembrane protein  24.73 
 
 		 684 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3796  site-specific recombinase-like  25.93 
 
 		 707 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0624  site-specific recombinase-like protein  25.49 
 
 		 707 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.232961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3662  putative site-specific recombinase transmembrane protein  27.23 
 
 		 654 aa  169  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2676  site-specific recombinase-like protein  25.29 
 
 		 728 aa  170  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0359  putative site-specific recombinase transmembrane protein  24.92 
 
 		 660 aa  167  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1023  putative site-specific recombinase transmembrane protein  23.33 
 
 		 703 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.926056  normal  0.592134 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0348  putative site-specific recombinase transmembrane protein  24.77 
 
 		 660 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0876893  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2054  putative site-specific recombinase transmembrane protein  24.43 
 
 		 706 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4468  putative site-specific recombinase transmembrane protein  25.96 
 
 		 657 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0492  putative site-specific recombinase transmembrane protein  25.33 
 
 		 656 aa  164  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0720  putative site-specific recombinase transmembrane protein  25.84 
 
 		 655 aa  160  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0436  putative site-specific recombinase transmembrane protein  24.96 
 
 		 663 aa  159  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27543 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1012  putative site-specific recombinase transmembrane protein  23.29 
 
 		 696 aa  153  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.644984 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>