28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00658 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00658  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  644    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001815  hypothetical protein  54.79 
 
 
315 aa  340  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0742692  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4029  lipopolysaccharide-modifying protein  42.37 
 
 
365 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.030521  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3915  lipopolysaccharide-modifying protein  42.37 
 
 
335 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1884  lipopolysaccharide core biosynthesis protien, putative  41.41 
 
 
311 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1172  conserved hypothetical protein, putative lipopolysaccharide core biosynthesis protein  39.8 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0010  lipopolysaccharide core biosynthesis protien, putative  43.23 
 
 
203 aa  171  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47324  predicted protein  31.09 
 
 
519 aa  99.4  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.37145  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48833  predicted protein  30 
 
 
562 aa  95.9  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.973466  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46351  predicted protein  29.65 
 
 
528 aa  93.2  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.87746  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48834  predicted protein  29.27 
 
 
597 aa  93.2  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.935241  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50016  predicted protein  44.94 
 
 
527 aa  90.5  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.993255  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49107  predicted protein  42.05 
 
 
553 aa  86.7  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.522307  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50325  predicted protein  43.33 
 
 
509 aa  85.1  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0839312  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33648  predicted protein  27.8 
 
 
595 aa  82.8  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44001  predicted protein  39.33 
 
 
449 aa  81.6  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.656856  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44629  predicted protein  27.96 
 
 
475 aa  80.1  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00982  putative lipopolysaccharide A protein  31.13 
 
 
381 aa  76.3  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07548  DUF821 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G14740)  28.4 
 
 
462 aa  62  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0532582  hitchhiker  0.00298707 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47114  predicted protein  29.67 
 
 
913 aa  55.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45739  predicted protein  36.92 
 
 
830 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000396127  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24498  predicted protein  48.98 
 
 
490 aa  51.2  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0174559 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31491  predicted protein  44.83 
 
 
559 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0179546 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04084  capsule-associated protein CAP1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05595)  35.64 
 
 
585 aa  47  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.887387  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_18789  predicted protein  31 
 
 
394 aa  46.2  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_18783  predicted protein  30 
 
 
396 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28499  predicted protein  30 
 
 
401 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08003  conserved hypothetical protein  24.26 
 
 
484 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.697493  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>