22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_44001 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_44001  predicted protein  100 
 
 		 449 aa  927    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.656856  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50325  predicted protein  40.48 
 
 		 509 aa  303  5.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0839312  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44629  predicted protein  39.42 
 
 		 475 aa  295  1e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50016  predicted protein  40.44 
 
 		 527 aa  292  6e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.993255  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48833  predicted protein  37.25 
 
 		 562 aa  275  2.0000000000000002e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.973466  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46351  predicted protein  38.74 
 
 		 528 aa  262  1e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.87746  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48834  predicted protein  36.18 
 
 		 597 aa  260  3e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.935241  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33648  predicted protein  35.9 
 
 		 595 aa  255  1.0000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47324  predicted protein  35.41 
 
 		 519 aa  247  3e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.37145  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49107  predicted protein  35.86 
 
 		 553 aa  243  5e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.522307  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47114  predicted protein  29.88 
 
 		 913 aa  155  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45739  predicted protein  33.15 
 
 		 830 aa  98.6  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000396127  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4029  lipopolysaccharide-modifying protein  28.57 
 
 		 365 aa  87  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.030521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3915  lipopolysaccharide-modifying protein  28.57 
 
 		 335 aa  87  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001815  hypothetical protein  27.19 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0742692  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00658  hypothetical protein  39.33 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1884  lipopolysaccharide core biosynthesis protien, putative  26.79 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1172  conserved hypothetical protein, putative lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25 
 
 		 325 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0010  lipopolysaccharide core biosynthesis protien, putative  25.84 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00982  putative lipopolysaccharide A protein  33 
 
 		 381 aa  51.6  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24498  predicted protein  30.34 
 
 		 490 aa  51.6  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0174559 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31491  predicted protein  32.14 
 
 		 559 aa  50.1  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0179546 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>