23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50016 on replicon NC_011694
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011694  PHATRDRAFT_50016  predicted protein  100 
 
 
527 aa  1095    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.993255  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50325  predicted protein  38.62 
 
 
509 aa  303  7.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0839312  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44001  predicted protein  40.44 
 
 
449 aa  292  8e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.656856  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44629  predicted protein  38.91 
 
 
475 aa  282  1e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46351  predicted protein  36.34 
 
 
528 aa  260  5.0000000000000005e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.87746  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49107  predicted protein  36.5 
 
 
553 aa  258  1e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.522307  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33648  predicted protein  34.42 
 
 
595 aa  254  3e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48833  predicted protein  38.72 
 
 
562 aa  247  3e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.973466  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48834  predicted protein  32.84 
 
 
597 aa  245  9.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.935241  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47324  predicted protein  31.17 
 
 
519 aa  236  7e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.37145  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47114  predicted protein  30.17 
 
 
913 aa  183  5.0000000000000004e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45739  predicted protein  30.55 
 
 
830 aa  133  6e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000396127  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00658  hypothetical protein  44.94 
 
 
308 aa  90.5  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001815  hypothetical protein  30.88 
 
 
315 aa  89.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0742692  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4029  lipopolysaccharide-modifying protein  36.19 
 
 
365 aa  77.4  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.030521  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3915  lipopolysaccharide-modifying protein  36.19 
 
 
335 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1172  conserved hypothetical protein, putative lipopolysaccharide core biosynthesis protein  32.76 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1884  lipopolysaccharide core biosynthesis protien, putative  32.2 
 
 
311 aa  64.3  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0010  lipopolysaccharide core biosynthesis protien, putative  31.36 
 
 
203 aa  60.5  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31491  predicted protein  44.68 
 
 
559 aa  55.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0179546 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00982  putative lipopolysaccharide A protein  29.41 
 
 
381 aa  53.9  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24498  predicted protein  40.43 
 
 
490 aa  50.4  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0174559 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_18789  predicted protein  25.6 
 
 
394 aa  44.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>