25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50325 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011696  PHATRDRAFT_50325  predicted protein  100 
 
 
509 aa  1068    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0839312  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44629  predicted protein  38.36 
 
 
475 aa  316  6e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44001  predicted protein  40.48 
 
 
449 aa  303  6.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.656856  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50016  predicted protein  38.62 
 
 
527 aa  303  7.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.993255  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49107  predicted protein  38.22 
 
 
553 aa  280  5e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.522307  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48833  predicted protein  37.34 
 
 
562 aa  271  2e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.973466  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46351  predicted protein  31.89 
 
 
528 aa  263  4e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.87746  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33648  predicted protein  36.18 
 
 
595 aa  263  6e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48834  predicted protein  37.1 
 
 
597 aa  255  1.0000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.935241  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47324  predicted protein  32.69 
 
 
519 aa  238  3e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.37145  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47114  predicted protein  30.88 
 
 
913 aa  182  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45739  predicted protein  34.26 
 
 
830 aa  119  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000396127  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001815  hypothetical protein  28.23 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0742692  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00658  hypothetical protein  43.33 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4029  lipopolysaccharide-modifying protein  30 
 
 
365 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.030521  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3915  lipopolysaccharide-modifying protein  29.47 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1172  conserved hypothetical protein, putative lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.53 
 
 
325 aa  75.9  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1884  lipopolysaccharide core biosynthesis protien, putative  29.47 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0010  lipopolysaccharide core biosynthesis protien, putative  28.95 
 
 
203 aa  67  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00982  putative lipopolysaccharide A protein  27.6 
 
 
381 aa  58.2  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28499  predicted protein  22.06 
 
 
401 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_18783  predicted protein  22.06 
 
 
396 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_18789  predicted protein  20.59 
 
 
394 aa  55.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31491  predicted protein  40.43 
 
 
559 aa  50.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0179546 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24498  predicted protein  44.68 
 
 
490 aa  49.3  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0174559 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>