28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48833 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_48834  predicted protein  57.43 
 
 		 597 aa  667    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.935241  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48833  predicted protein  100 
 
 		 562 aa  1174    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.973466  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33648  predicted protein  53.23 
 
 		 595 aa  541  9.999999999999999e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47324  predicted protein  51.32 
 
 		 519 aa  483  1e-135  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.37145  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46351  predicted protein  38.01 
 
 		 528 aa  299  1e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.87746  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49107  predicted protein  38.8 
 
 		 553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.522307  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44001  predicted protein  37.25 
 
 		 449 aa  275  2.0000000000000002e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.656856  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50325  predicted protein  37.34 
 
 		 509 aa  271  2e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0839312  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50016  predicted protein  38.72 
 
 		 527 aa  247  4e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.993255  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44629  predicted protein  31.81 
 
 		 475 aa  234  4.0000000000000004e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47114  predicted protein  29.28 
 
 		 913 aa  167  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45739  predicted protein  30.73 
 
 		 830 aa  108  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000396127  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001815  hypothetical protein  31.68 
 
 		 315 aa  100  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0742692  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00658  hypothetical protein  30 
 
 		 308 aa  95.9  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4029  lipopolysaccharide-modifying protein  27.8 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.030521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3915  lipopolysaccharide-modifying protein  27.8 
 
 		 335 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1884  lipopolysaccharide core biosynthesis protien, putative  25.38 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1172  conserved hypothetical protein, putative lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.63 
 
 		 325 aa  72.8  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0010  lipopolysaccharide core biosynthesis protien, putative  25.26 
 
 		 203 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_18789  predicted protein  25.52 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28499  predicted protein  25.26 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_18783  predicted protein  25 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00982  putative lipopolysaccharide A protein  27.13 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02330  conserved hypothetical protein  29.53 
 
 		 525 aa  50.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.723576  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04084  capsule-associated protein CAP1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05595)  27.49 
 
 		 585 aa  47.8  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.887387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31491  predicted protein  29.08 
 
 		 559 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0179546 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24498  predicted protein  38.3 
 
 		 490 aa  45.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0174559 
 
 
-
 
NC_006686  CND05940  capsular associated protein  26.5 
 
 		 641 aa  44.7  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.203249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>