28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001815 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001815  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  653    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0742692  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00658  hypothetical protein  54.79 
 
 		 308 aa  340  1e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4029  lipopolysaccharide-modifying protein  41.38 
 
 		 365 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.030521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3915  lipopolysaccharide-modifying protein  41.38 
 
 		 335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1172  conserved hypothetical protein, putative lipopolysaccharide core biosynthesis protein  39.78 
 
 		 325 aa  201  9e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1884  lipopolysaccharide core biosynthesis protien, putative  37.16 
 
 		 311 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0010  lipopolysaccharide core biosynthesis protien, putative  43.62 
 
 		 203 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48833  predicted protein  31.68 
 
 		 562 aa  100  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.973466  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47324  predicted protein  31.31 
 
 		 519 aa  99.4  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.37145  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33648  predicted protein  31.22 
 
 		 595 aa  92.4  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46351  predicted protein  29.52 
 
 		 528 aa  90.1  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.87746  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50016  predicted protein  30.88 
 
 		 527 aa  89.7  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.993255  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48834  predicted protein  30.77 
 
 		 597 aa  89.4  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.935241  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44629  predicted protein  30.16 
 
 		 475 aa  87  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50325  predicted protein  28.23 
 
 		 509 aa  84.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0839312  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44001  predicted protein  27.19 
 
 		 449 aa  81.6  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.656856  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49107  predicted protein  25.27 
 
 		 553 aa  82  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.522307  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00982  putative lipopolysaccharide A protein  25.24 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07548  DUF821 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G14740)  25.79 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0532582  hitchhiker  0.00298707 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47114  predicted protein  27.27 
 
 		 913 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08003  conserved hypothetical protein  24.85 
 
 		 484 aa  46.6  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.697493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31491  predicted protein  41.38 
 
 		 559 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0179546 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02330  conserved hypothetical protein  23.04 
 
 		 525 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.723576  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24498  predicted protein  40.82 
 
 		 490 aa  43.5  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0174559 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_18789  predicted protein  27.45 
 
 		 394 aa  43.5  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_18783  predicted protein  28.43 
 
 		 396 aa  43.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28499  predicted protein  28.43 
 
 		 401 aa  43.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3877  hypothetical protein  47.27 
 
 		 357 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>