19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1172 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1172  conserved hypothetical protein, putative lipopolysaccharide core biosynthesis protein  100 
 
 		 325 aa  657    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1884  lipopolysaccharide core biosynthesis protien, putative  55.94 
 
 		 311 aa  333  3e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0010  lipopolysaccharide core biosynthesis protien, putative  57.42 
 
 		 203 aa  229  5e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001815  hypothetical protein  39.78 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0742692  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00658  hypothetical protein  39.8 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3915  lipopolysaccharide-modifying protein  34.41 
 
 		 335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4029  lipopolysaccharide-modifying protein  34.41 
 
 		 365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.030521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46351  predicted protein  31.19 
 
 		 528 aa  83.6  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.87746  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49107  predicted protein  26.36 
 
 		 553 aa  80.5  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.522307  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47324  predicted protein  27.09 
 
 		 519 aa  75.9  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.37145  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50325  predicted protein  23.53 
 
 		 509 aa  75.9  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0839312  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44001  predicted protein  25 
 
 		 449 aa  72.8  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.656856  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48833  predicted protein  26.63 
 
 		 562 aa  72.8  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.973466  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33648  predicted protein  28.27 
 
 		 595 aa  70.9  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48834  predicted protein  27.46 
 
 		 597 aa  70.1  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.935241  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50016  predicted protein  32.76 
 
 		 527 aa  66.6  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.993255  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44629  predicted protein  25.26 
 
 		 475 aa  66.2  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00982  putative lipopolysaccharide A protein  24.53 
 
 		 381 aa  62  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47114  predicted protein  23.81 
 
 		 913 aa  42.7  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>