23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4029 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4029  lipopolysaccharide-modifying protein  100 
 
 		 365 aa  768    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.030521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3915  lipopolysaccharide-modifying protein  100 
 
 		 335 aa  705    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00658  hypothetical protein  42.37 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001815  hypothetical protein  41.38 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0742692  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1172  conserved hypothetical protein, putative lipopolysaccharide core biosynthesis protein  34.41 
 
 		 325 aa  190  4e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1884  lipopolysaccharide core biosynthesis protien, putative  36.65 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0010  lipopolysaccharide core biosynthesis protien, putative  42.55 
 
 		 203 aa  159  8e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47324  predicted protein  30.29 
 
 		 519 aa  87  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.37145  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44001  predicted protein  28.57 
 
 		 449 aa  87  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.656856  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48833  predicted protein  27.8 
 
 		 562 aa  83.6  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.973466  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48834  predicted protein  28.71 
 
 		 597 aa  83.2  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.935241  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49107  predicted protein  30.21 
 
 		 553 aa  82  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.522307  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46351  predicted protein  29.58 
 
 		 528 aa  79.3  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.87746  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50325  predicted protein  30 
 
 		 509 aa  78.6  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0839312  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50016  predicted protein  36.19 
 
 		 527 aa  77.4  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.993255  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44629  predicted protein  30.81 
 
 		 475 aa  74.7  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33648  predicted protein  27.09 
 
 		 595 aa  74.3  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00982  putative lipopolysaccharide A protein  28.1 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02330  conserved hypothetical protein  26.19 
 
 		 525 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.723576  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47114  predicted protein  26.67 
 
 		 913 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28499  predicted protein  25.93 
 
 		 401 aa  43.9  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_18783  predicted protein  25.93 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_18789  predicted protein  25 
 
 		 394 aa  43.5  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>