24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_33648 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_33648  predicted protein  100 
 
 
595 aa  1236    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48834  predicted protein  52.71 
 
 
597 aa  553  1e-156  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.935241  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48833  predicted protein  53.23 
 
 
562 aa  541  9.999999999999999e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.973466  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47324  predicted protein  52.4 
 
 
519 aa  488  1e-136  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.37145  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46351  predicted protein  38.18 
 
 
528 aa  291  2e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.87746  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49107  predicted protein  37.29 
 
 
553 aa  286  5e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.522307  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50325  predicted protein  36.18 
 
 
509 aa  263  8e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0839312  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44001  predicted protein  35.9 
 
 
449 aa  255  2.0000000000000002e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.656856  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50016  predicted protein  34.42 
 
 
527 aa  254  3e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.993255  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44629  predicted protein  33.04 
 
 
475 aa  243  7e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47114  predicted protein  32.68 
 
 
913 aa  142  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45739  predicted protein  33.67 
 
 
830 aa  111  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000396127  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001815  hypothetical protein  31.22 
 
 
315 aa  92.4  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0742692  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00658  hypothetical protein  27.8 
 
 
308 aa  82.8  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4029  lipopolysaccharide-modifying protein  27.09 
 
 
365 aa  74.3  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.030521  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3915  lipopolysaccharide-modifying protein  26.6 
 
 
335 aa  73.9  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1884  lipopolysaccharide core biosynthesis protien, putative  26.07 
 
 
311 aa  73.2  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1172  conserved hypothetical protein, putative lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.27 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0010  lipopolysaccharide core biosynthesis protien, putative  26 
 
 
203 aa  64.3  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00982  putative lipopolysaccharide A protein  30.19 
 
 
381 aa  55.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24498  predicted protein  33.59 
 
 
490 aa  53.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0174559 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31491  predicted protein  31.91 
 
 
559 aa  51.6  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0179546 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_18783  predicted protein  23.26 
 
 
396 aa  44.3  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28499  predicted protein  23.26 
 
 
401 aa  43.9  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>