26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47324 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_47324  predicted protein  100 
 
 
519 aa  1081    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.37145  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48834  predicted protein  54.79 
 
 
597 aa  514  1e-144  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.935241  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33648  predicted protein  52.4 
 
 
595 aa  488  1e-136  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48833  predicted protein  51.32 
 
 
562 aa  483  1e-135  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.973466  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46351  predicted protein  35.12 
 
 
528 aa  274  3e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.87746  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49107  predicted protein  35.22 
 
 
553 aa  266  8e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.522307  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44001  predicted protein  35.41 
 
 
449 aa  247  3e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.656856  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50325  predicted protein  32.69 
 
 
509 aa  238  3e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0839312  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50016  predicted protein  31.17 
 
 
527 aa  236  7e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.993255  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44629  predicted protein  32.84 
 
 
475 aa  230  5e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47114  predicted protein  29.98 
 
 
913 aa  150  5e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45739  predicted protein  30.91 
 
 
830 aa  109  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000396127  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00658  hypothetical protein  31.09 
 
 
308 aa  99.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001815  hypothetical protein  31.31 
 
 
315 aa  99.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0742692  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1884  lipopolysaccharide core biosynthesis protien, putative  27.94 
 
 
311 aa  89.7  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4029  lipopolysaccharide-modifying protein  30.29 
 
 
365 aa  87  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.030521  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3915  lipopolysaccharide-modifying protein  30.29 
 
 
335 aa  87  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0010  lipopolysaccharide core biosynthesis protien, putative  27.84 
 
 
203 aa  82.8  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1172  conserved hypothetical protein, putative lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.09 
 
 
325 aa  75.9  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00982  putative lipopolysaccharide A protein  29.3 
 
 
381 aa  58.5  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31491  predicted protein  37.78 
 
 
559 aa  50.4  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0179546 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24498  predicted protein  38.3 
 
 
490 aa  48.5  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0174559 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02330  conserved hypothetical protein  25.73 
 
 
525 aa  45.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.723576  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_18789  predicted protein  24.39 
 
 
394 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05940  capsular associated protein  36.59 
 
 
641 aa  45.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.203249  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02810  CAP1-related  25.48 
 
 
636 aa  43.5  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.200146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>