21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46351 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_46351  predicted protein  100 
 
 
528 aa  1084    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.87746  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48834  predicted protein  38.55 
 
 
597 aa  302  9e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.935241  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48833  predicted protein  38.01 
 
 
562 aa  299  1e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.973466  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33648  predicted protein  38.18 
 
 
595 aa  291  1e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49107  predicted protein  38.45 
 
 
553 aa  291  2e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.522307  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47324  predicted protein  35.12 
 
 
519 aa  274  3e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.37145  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50325  predicted protein  31.89 
 
 
509 aa  263  4.999999999999999e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0839312  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44001  predicted protein  38.74 
 
 
449 aa  262  1e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.656856  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50016  predicted protein  36.34 
 
 
527 aa  260  5.0000000000000005e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.993255  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44629  predicted protein  36.89 
 
 
475 aa  258  2e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47114  predicted protein  28.48 
 
 
913 aa  169  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45739  predicted protein  38.07 
 
 
830 aa  131  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000396127  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00658  hypothetical protein  29.65 
 
 
308 aa  93.2  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001815  hypothetical protein  29.52 
 
 
315 aa  90.1  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0742692  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1172  conserved hypothetical protein, putative lipopolysaccharide core biosynthesis protein  31.19 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4029  lipopolysaccharide-modifying protein  29.58 
 
 
365 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.030521  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3915  lipopolysaccharide-modifying protein  29.58 
 
 
335 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1884  lipopolysaccharide core biosynthesis protien, putative  26.32 
 
 
311 aa  75.9  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0010  lipopolysaccharide core biosynthesis protien, putative  26.37 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04084  capsule-associated protein CAP1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05595)  27.56 
 
 
585 aa  51.6  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.887387  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00982  putative lipopolysaccharide A protein  26.99 
 
 
381 aa  48.9  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>