More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001545 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001545  3-ketoacyl-CoA thiolase (isoleucine degradation)  100 
 
 		 403 aa  828    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05482  acyl-CoA thiolase  83.62 
 
 		 403 aa  707    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000375  3-ketoacyl-CoA thiolase (isoleucine degradation)  59.06 
 
 		 392 aa  489  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.587204  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  59.06 
 
 		 396 aa  485  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.184491  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1525  acetyl-CoA acetyltransferase  58.56 
 
 		 396 aa  474  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2856  acetyl-CoA acetyltransferase  58.56 
 
 		 396 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.700785  hitchhiker  0.0000000577054 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1473  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  59 
 
 		 396 aa  478  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066272 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1495  acetyl-CoA acetyltransferase  58.56 
 
 		 396 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1489  acetyl-CoA acetyltransferase  58.56 
 
 		 396 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1667  acetyl-CoA acetyltransferase  58.46 
 
 		 396 aa  473  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00240927  normal  0.0395085 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1677  acetyl-CoA acetyltransferase  59.06 
 
 		 396 aa  473  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3202  acetyl-CoA acetyltransferase  58.06 
 
 		 400 aa  473  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.573759  hitchhiker  0.000000552223 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1397  acetyl-CoA acetyltransferase  58.31 
 
 		 396 aa  474  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2771  acetyl-CoA acetyltransferases  58.81 
 
 		 396 aa  472  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384582 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1943  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  57.71 
 
 		 396 aa  472  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2597  acetyl-CoA acetyltransferases  58.81 
 
 		 396 aa  474  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.124801  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2664  acetyl-CoA acetyltransferases  58.56 
 
 		 396 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.304657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1338  acetyl-CoA acetyltransferases  57.36 
 
 		 396 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.671481  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1375  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  58.25 
 
 		 392 aa  463  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.692424  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02410  acetyl-CoA acetyltransferase with thiolase domain  56.5 
 
 		 416 aa  462  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0732  acetyl-CoA acetyltransferase  57.25 
 
 		 402 aa  458  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0178  acetyl-CoA acetyltransferase  58 
 
 		 396 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4255  acetyl-CoA acetyltransferase  57 
 
 		 402 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2923  acetyl-CoA acetyltransferases  55.89 
 
 		 394 aa  448  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0461  acetyl-CoA acetyltransferase  56.75 
 
 		 397 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.843393 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0344  acetyl-CoA acetyltransferase  57.5 
 
 		 397 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0126  acetyl-CoA acetyltransferase  55.45 
 
 		 393 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.524714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1182  putative acyl-CoA thiolase  55.75 
 
 		 391 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0134  acetyl-CoA acetyltransferase  55.94 
 
 		 393 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0276  acetyl-CoA acetyltransferase  55.69 
 
 		 393 aa  442  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00380599  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1788  hypothetical protein  56.22 
 
 		 394 aa  443  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1789  hypothetical protein  55.97 
 
 		 394 aa  441  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0252  putative acetyl-CoA acyltransferase  55.89 
 
 		 393 aa  441  1e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.152844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2010  acetyl-CoA acetyltransferase  57.57 
 
 		 397 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2277  acetyl-CoA acetyltransferase  57.57 
 
 		 397 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0096  acetyl-CoA acetyltransferase  57.57 
 
 		 397 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.825605  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0138  acetyl-CoA acetyltransferase  55.69 
 
 		 393 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.998438  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0417  acetyl-CoA acetyltransferase  57.57 
 
 		 397 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0579  acetyl-CoA acetyltransferase  57.57 
 
 		 397 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1891  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  54.5 
 
 		 391 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  57.32 
 
 		 397 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2547  acetyl-CoA acetyltransferase  55.89 
 
 		 395 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2868  thiolase  56.64 
 
 		 396 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13090  putative acyl-CoA thiolase  55.5 
 
 		 391 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3662  acetyl-CoA acetyltransferase  54 
 
 		 391 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2011  acetyl-CoA acetyltransferase  54.89 
 
 		 393 aa  432  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271302  normal  0.806443 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  56.03 
 
 		 399 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158877 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0106  acetyl-CoA acetyltransferase  55.56 
 
 		 394 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3107  acetyl-CoA acetyltransferase  56.64 
 
 		 396 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.218228  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1841  acetyl-CoA acetyltransferase  56.39 
 
 		 397 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.219092  normal  0.268333 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2117  acetyl-CoA acetyltransferase  54.98 
 
 		 393 aa  430  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.465032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07370  Thiolase  55.67 
 
 		 395 aa  430  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182394  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5347  acetyl-CoA acetyltransferase  56.14 
 
 		 396 aa  428  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0980846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2215  acetyl-CoA acetyltransferase  55.89 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5943  thiolase  58.31 
 
 		 400 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3523  acetyl-CoA acetyltransferase  55.64 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.15096 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3149  phosphoryl transfer system, HPr  54.84 
 
 		 392 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5725  acetyl-CoA acetyltransferase  55.14 
 
 		 396 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5969  acetyl-CoA acetyltransferases  55.14 
 
 		 396 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.661429 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0965  acetyl-CoA acetyltransferase  54.59 
 
 		 394 aa  421  1e-117  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1605  acetyl-CoA acetyltransferase  56.14 
 
 		 394 aa  424  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4665  acetyl-CoA acetyltransferase  55.09 
 
 		 398 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226383  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1073  acetyl-CoA acetyltransferase  54.34 
 
 		 394 aa  422  1e-117  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0098  thiolase  54.79 
 
 		 396 aa  423  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4561  thiolase  54.34 
 
 		 393 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0602152  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3456  acetyl-CoA acetyltransferase  55.64 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614385  normal  0.375478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3105  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  56.14 
 
 		 395 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0273238 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0278  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  55.64 
 
 		 393 aa  424  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000883017  normal  0.145128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3164  acetyl-CoA acetyltransferase  53 
 
 		 402 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.783453  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6652  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  55.89 
 
 		 396 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408769  normal  0.0141058 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2696  acetyl-CoA acetyltransferase  53.35 
 
 		 394 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0145764  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2036  acetyl-CoA acetyltransferase  54.5 
 
 		 395 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.657268 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5096  acetyl-CoA acetyltransferase  54.25 
 
 		 395 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392469  normal  0.97471 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1001  acetyl-CoA acetyltransferase  53.5 
 
 		 400 aa  411  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5988  acetyl-CoA acetyltransferase  53.47 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304817 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1599  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  56.39 
 
 		 396 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462018  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3575  acetyl-CoA acetyltransferase  52.87 
 
 		 395 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.313168  normal  0.776958 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6232  acetyl-CoA acetyltransferases  56.39 
 
 		 396 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799558  normal  0.0748804 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6708  acetyl-CoA acetyltransferase  56.64 
 
 		 396 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331471  normal  0.555202 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3031  thiolase  54.09 
 
 		 402 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.589466  normal  0.04757 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3085  acetyl-CoA acetyltransferase  58.68 
 
 		 398 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.833369  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0067  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  53.4 
 
 		 390 aa  410  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0458  acetyl-CoA acetyltransferases  51.98 
 
 		 393 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.902718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3602  acetyl-CoA acetyltransferase  51.75 
 
 		 394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.324693 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2907  acetyl-CoA acetyltransferases  55.67 
 
 		 393 aa  406  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4050  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  52.87 
 
 		 387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4941  acetyl-CoA acetyltransferase  53.98 
 
 		 396 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0781  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  51.5 
 
 		 395 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4383  acetyl-CoA acetyltransferase  53.85 
 
 		 395 aa  405  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.325311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4368  acetyl-CoA acetyltransferase  51.36 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2683  putative acyl-CoA thiolase  53.73 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0612266  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4187  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50.74 
 
 		 393 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3306  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  52.11 
 
 		 395 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.836004 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31530  putative acyl-CoA thiolase  53.98 
 
 		 396 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812461  hitchhiker  0.0000999697 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2955  acetyl-CoA acetyltransferase  53.5 
 
 		 391 aa  395  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000192341  hitchhiker  0.000874312 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3776  acetyl-CoA acetyltransferases  52 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6505  acetyl-CoA acetyltransferase  54.84 
 
 		 395 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.41485  normal  0.431537 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3054  acetyl-CoA acetyltransferase  52 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6128  acetyl-CoA acetyltransferase  50.75 
 
 		 389 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0513705 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4732  acetyl-CoA acetyltransferase  51.36 
 
 		 394 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>