30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0329 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0329  hutX protein  100 
 
 		 167 aa  344  3e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0562944  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001357  putative heme iron utilization protein  69.46 
 
 		 177 aa  248  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.224077  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05246  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  70.06 
 
 		 171 aa  245  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1749  heme uptake and utilization protein HuvX  56.29 
 
 		 168 aa  195  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203963  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3326  hypothetical protein  52.83 
 
 		 174 aa  186  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.120609  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3234  heme utilization protein HuvX  50.32 
 
 		 188 aa  175  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00279446  normal  0.899142 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0953  hypothetical protein  51.59 
 
 		 209 aa  174  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3668  hypothetical protein  50.32 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1055  hypothetical protein  50.32 
 
 		 209 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.260591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1022  hypothetical protein  50.96 
 
 		 203 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950175  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3337  protein of unknown function DUF1008  49.04 
 
 		 189 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0207771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0967  hypothetical protein  51.32 
 
 		 190 aa  169  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4003  hypothetical protein  45.12 
 
 		 168 aa  166  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.426108 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0723  heme utilization protein HuvX  47.83 
 
 		 164 aa  157  5e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0791  hypothetical protein  45.81 
 
 		 184 aa  154  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00123186  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3806  hypothetical protein  36.71 
 
 		 164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0394608 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2326  hypothetical protein  35.19 
 
 		 176 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0409138  normal  0.753421 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3798  hypothetical protein  39.49 
 
 		 187 aa  117  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0255184  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0653  hypothetical protein  39.49 
 
 		 181 aa  117  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.80145  normal  0.286593 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3886  hypothetical protein  39.49 
 
 		 187 aa  117  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0909585  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0383  hypothetical protein  37.01 
 
 		 185 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1975  hypothetical protein  36.31 
 
 		 171 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4863  hypothetical protein  36.71 
 
 		 164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.338435 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2356  hypothetical protein  35.29 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0624105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2417  protein of unknown function DUF1008  35.26 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2043  HuvX protein  33.14 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0160  hypothetical protein  36.31 
 
 		 175 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1520  protein of unknown function DUF1008  34.84 
 
 		 166 aa  107  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.416519  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2749  hypothetical protein  33.55 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2731  hypothetical protein  29.03 
 
 		 177 aa  87.8  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.532085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>