30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2326 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2326  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  362  1e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0409138  normal  0.753421 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1975  hypothetical protein  77.85 
 
 
171 aa  260  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157638  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0160  hypothetical protein  73.91 
 
 
175 aa  246  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2356  hypothetical protein  70.55 
 
 
175 aa  241  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0624105  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2417  protein of unknown function DUF1008  71.52 
 
 
178 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0653  hypothetical protein  47.5 
 
 
181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.80145  normal  0.286593 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2749  hypothetical protein  46.5 
 
 
166 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3798  hypothetical protein  47.47 
 
 
187 aa  144  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0255184  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3886  hypothetical protein  47.47 
 
 
187 aa  144  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0909585  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1520  protein of unknown function DUF1008  46.5 
 
 
166 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.416519  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0383  hypothetical protein  47.17 
 
 
185 aa  144  8.000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3806  hypothetical protein  38.85 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0394608 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4863  hypothetical protein  39.49 
 
 
164 aa  124  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.338435 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0329  hutX protein  35.19 
 
 
167 aa  117  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0562944  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0723  heme utilization protein HuvX  36.02 
 
 
164 aa  115  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001357  putative heme iron utilization protein  35.58 
 
 
177 aa  114  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.224077  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2731  hypothetical protein  36.84 
 
 
177 aa  114  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.532085  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05246  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.85 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4003  hypothetical protein  38.85 
 
 
168 aa  112  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.426108 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3326  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  111  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.120609  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3668  hypothetical protein  36.13 
 
 
186 aa  107  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0953  hypothetical protein  39.26 
 
 
209 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3234  heme utilization protein HuvX  35.03 
 
 
188 aa  105  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00279446  normal  0.899142 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3337  protein of unknown function DUF1008  34.36 
 
 
189 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0207771  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0967  hypothetical protein  35 
 
 
190 aa  104  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1749  heme uptake and utilization protein HuvX  33.13 
 
 
168 aa  104  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203963  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1055  hypothetical protein  33.74 
 
 
209 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.260591  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1022  hypothetical protein  33.74 
 
 
203 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950175  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0791  hypothetical protein  32.54 
 
 
184 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00123186  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2043  HuvX protein  30 
 
 
170 aa  91.3  6e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>