33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3234 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3234  heme utilization protein HuvX  100 
 
 		 188 aa  385  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00279446  normal  0.899142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3668  hypothetical protein  84.32 
 
 		 186 aa  317  7e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1055  hypothetical protein  72.16 
 
 		 209 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.260591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0953  hypothetical protein  71.65 
 
 		 209 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0967  hypothetical protein  77.9 
 
 		 190 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1022  hypothetical protein  73.94 
 
 		 203 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950175  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3337  protein of unknown function DUF1008  73.4 
 
 		 189 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0207771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3326  hypothetical protein  67.72 
 
 		 174 aa  228  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.120609  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4003  hypothetical protein  63.92 
 
 		 168 aa  224  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.426108 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0791  hypothetical protein  62.11 
 
 		 184 aa  223  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00123186  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0329  hutX protein  50.32 
 
 		 167 aa  175  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0562944  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05246  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.68 
 
 		 171 aa  155  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001357  putative heme iron utilization protein  50 
 
 		 177 aa  154  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.224077  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1749  heme uptake and utilization protein HuvX  45.62 
 
 		 168 aa  146  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203963  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0723  heme utilization protein HuvX  43.92 
 
 		 164 aa  131  6.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0653  hypothetical protein  42.77 
 
 		 181 aa  129  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.80145  normal  0.286593 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3886  hypothetical protein  44.59 
 
 		 187 aa  128  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0909585  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3798  hypothetical protein  44.59 
 
 		 187 aa  128  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0255184  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0383  hypothetical protein  36.59 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2749  hypothetical protein  35.8 
 
 		 166 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1520  protein of unknown function DUF1008  35.19 
 
 		 166 aa  115  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.416519  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2356  hypothetical protein  35.4 
 
 		 175 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0624105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4863  hypothetical protein  38.85 
 
 		 164 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.338435 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3806  hypothetical protein  38.22 
 
 		 164 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0394608 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2417  protein of unknown function DUF1008  33.74 
 
 		 178 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2326  hypothetical protein  35.03 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0409138  normal  0.753421 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0160  hypothetical protein  33.74 
 
 		 175 aa  104  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1975  hypothetical protein  33.78 
 
 		 171 aa  97.4  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2731  hypothetical protein  30.38 
 
 		 177 aa  92.8  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.532085  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2043  HuvX protein  29.11 
 
 		 170 aa  86.7  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2036  Hemin-degrading family protein  30.61 
 
 		 346 aa  45.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0183  hemin-degrading family protein  21.56 
 
 		 350 aa  43.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0870539 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1507  hemin-degrading family protein  29.94 
 
 		 394 aa  41.2  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.823077  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>