30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2356 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2356  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  358  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0624105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0160  hypothetical protein  85.12 
 
 		 175 aa  296  8e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2417  protein of unknown function DUF1008  78.7 
 
 		 178 aa  279  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1975  hypothetical protein  73.46 
 
 		 171 aa  247  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2326  hypothetical protein  70.55 
 
 		 176 aa  241  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0409138  normal  0.753421 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2749  hypothetical protein  46.3 
 
 		 166 aa  153  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1520  protein of unknown function DUF1008  46.3 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.416519  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0653  hypothetical protein  45.1 
 
 		 181 aa  144  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.80145  normal  0.286593 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3886  hypothetical protein  45.1 
 
 		 187 aa  144  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0909585  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3798  hypothetical protein  45.1 
 
 		 187 aa  144  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0255184  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0383  hypothetical protein  41.72 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2731  hypothetical protein  39.16 
 
 		 177 aa  137  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.532085  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4863  hypothetical protein  40.25 
 
 		 164 aa  137  8.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.338435 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3806  hypothetical protein  38.61 
 
 		 164 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0394608 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3326  hypothetical protein  37.2 
 
 		 174 aa  123  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.120609  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4003  hypothetical protein  40.85 
 
 		 168 aa  121  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.426108 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0723  heme utilization protein HuvX  38.82 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05246  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.62 
 
 		 171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3337  protein of unknown function DUF1008  36.2 
 
 		 189 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0207771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001357  putative heme iron utilization protein  37.42 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.224077  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0329  hutX protein  35.29 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0562944  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1055  hypothetical protein  34.97 
 
 		 209 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.260591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0967  hypothetical protein  35.44 
 
 		 190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3234  heme utilization protein HuvX  35.4 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00279446  normal  0.899142 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0953  hypothetical protein  34.36 
 
 		 209 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3668  hypothetical protein  35.85 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1022  hypothetical protein  34.36 
 
 		 203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950175  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1749  heme uptake and utilization protein HuvX  34.34 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203963  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0791  hypothetical protein  32.73 
 
 		 184 aa  101  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00123186  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2043  HuvX protein  28.31 
 
 		 170 aa  92  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>