30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0723 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0723  heme utilization protein HuvX  100 
 
 
164 aa  341  2.9999999999999997e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0329  hutX protein  47.83 
 
 
167 aa  157  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0562944  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05246  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.34 
 
 
171 aa  140  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3326  hypothetical protein  43.04 
 
 
174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.120609  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001357  putative heme iron utilization protein  44.72 
 
 
177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.224077  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4003  hypothetical protein  43.75 
 
 
168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.426108 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3234  heme utilization protein HuvX  43.92 
 
 
188 aa  131  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00279446  normal  0.899142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0967  hypothetical protein  45 
 
 
190 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0953  hypothetical protein  45 
 
 
209 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1055  hypothetical protein  45 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.260591  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1022  hypothetical protein  45 
 
 
203 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950175  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3668  hypothetical protein  40.76 
 
 
186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3337  protein of unknown function DUF1008  44.29 
 
 
189 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0207771  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1749  heme uptake and utilization protein HuvX  42.59 
 
 
168 aa  124  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203963  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0791  hypothetical protein  40.51 
 
 
184 aa  123  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00123186  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2356  hypothetical protein  38.82 
 
 
175 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0624105  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0160  hypothetical protein  36.6 
 
 
175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2326  hypothetical protein  36.02 
 
 
176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0409138  normal  0.753421 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2417  protein of unknown function DUF1008  36.31 
 
 
178 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1975  hypothetical protein  36.54 
 
 
171 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157638  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0383  hypothetical protein  32.67 
 
 
185 aa  100  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2043  HuvX protein  31.93 
 
 
170 aa  96.3  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0653  hypothetical protein  32.08 
 
 
181 aa  94  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.80145  normal  0.286593 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3798  hypothetical protein  32.69 
 
 
187 aa  93.6  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0255184  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3886  hypothetical protein  32.69 
 
 
187 aa  93.6  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0909585  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2749  hypothetical protein  30.38 
 
 
166 aa  91.7  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1520  protein of unknown function DUF1008  30.57 
 
 
166 aa  91.3  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.416519  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2731  hypothetical protein  28.29 
 
 
177 aa  86.3  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.532085  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3806  hypothetical protein  31.69 
 
 
164 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0394608 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4863  hypothetical protein  30.28 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.338435 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>